59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0859 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0859  hypothetical protein  100 
 
 		 217 aa  450  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.458029 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4544  hypothetical protein  85.71 
 
 		 217 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.25009  normal  0.60166 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0941  protein of unknown function DUF1007  76.04 
 
 		 217 aa  354  5e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.049615  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4840  hypothetical protein  74.36 
 
 		 235 aa  315  4e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1352  hypothetical protein  65.13 
 
 		 211 aa  279  2e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564815  normal  0.361884 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2906  hypothetical protein  51.4 
 
 		 214 aa  227  8e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.162996 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0392  hypothetical protein  44.65 
 
 		 216 aa  186  3e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0855106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0082  hypothetical protein  37.5 
 
 		 243 aa  153  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.663458  normal  0.855004 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1404  hypothetical protein  41.44 
 
 		 225 aa  153  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.384967  normal  0.0196472 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1679  protein of unknown function DUF1007  40.99 
 
 		 225 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355728  normal  0.476153 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2332  hypothetical protein  42.41 
 
 		 209 aa  151  8.999999999999999e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0375324  normal  0.144839 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5736  protein of unknown function DUF1007  38.58 
 
 		 221 aa  150  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0278  protein of unknown function DUF1007  41.27 
 
 		 214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0696628  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1783  protein of unknown function DUF1007  36.41 
 
 		 211 aa  144  1e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1399  protein of unknown function DUF1007  39.59 
 
 		 219 aa  144  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0330358  normal  0.0597647 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2246  hypothetical protein  40.1 
 
 		 224 aa  143  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.5057  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0097  hypothetical protein  31.7 
 
 		 234 aa  107  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0089  hypothetical protein  31.7 
 
 		 234 aa  107  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.516634  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2203  hypothetical protein  31.88 
 
 		 224 aa  106  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0980814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1043  protein of unknown function DUF1007  33.51 
 
 		 218 aa  105  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.329942  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4248  hypothetical protein  30.37 
 
 		 231 aa  97.8  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2712  hypothetical protein  29.76 
 
 		 219 aa  97.4  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2975  protein of unknown function DUF1007  28.11 
 
 		 223 aa  90.9  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3809  hypothetical protein  29.47 
 
 		 219 aa  89.4  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2375  protein of unknown function DUF1007  25.57 
 
 		 221 aa  88.6  7e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.18361 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3632  hypothetical protein  30.28 
 
 		 222 aa  84.7  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0832359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0752  protein of unknown function DUF1007  26.11 
 
 		 226 aa  82.8  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0000375765  normal  0.714268 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3392  protein of unknown function DUF1007  26.17 
 
 		 213 aa  82.8  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0149032 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1660  hypothetical protein  28.65 
 
 		 232 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0619256  normal  0.666853 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2774  hypothetical protein  25.12 
 
 		 214 aa  79.3  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3032  hypothetical protein  27.4 
 
 		 212 aa  74.7  0.0000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.199492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1271  hypothetical protein  26.53 
 
 		 224 aa  72  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00860281  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1163  hypothetical protein  26.53 
 
 		 224 aa  72  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000035271  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0440  hypothetical protein  26.53 
 
 		 224 aa  72  0.000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000354485  hitchhiker  0.00000494731 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1095  protein of unknown function DUF1007  27.36 
 
 		 220 aa  72  0.000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1754  hypothetical protein  26.48 
 
 		 216 aa  68.2  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1975  putative lipoprotein  26.56 
 
 		 220 aa  67.4  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3679  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  27.84 
 
 		 222 aa  64.7  0.0000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.928215  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1233  protein of unknown function DUF1007  28.06 
 
 		 202 aa  64.7  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3209  hypothetical protein  21.72 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2760  protein of unknown function DUF1007  27.93 
 
 		 220 aa  63.9  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0284  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like  29.3 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0329928  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3691  protein of unknown function DUF1007  25 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.366003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4269  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  27.27 
 
 		 224 aa  62  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1826  normal  0.655735 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3042  hypothetical protein  26.8 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0486722  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0675  protein of unknown function DUF1007  24.12 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.019732 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0833  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component related protein  27.7 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.279263  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2793  hypothetical protein  25.82 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2927  hypothetical protein  25.58 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2814  hypothetical protein  25.58 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2752  hypothetical protein  25.58 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2707  hypothetical protein  25.58 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.874677  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1594  polyphosphate kinase  23.5 
 
 		 433 aa  54.3  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0936012 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0115  hypothetical protein  21.74 
 
 		 215 aa  53.5  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0287107  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1928  hypothetical protein  23.08 
 
 		 222 aa  49.7  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.449799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0285  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  25.54 
 
 		 187 aa  44.3  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.396844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1738  hypothetical protein  19.8 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0927626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1080  hypothetical protein  20.18 
 
 		 213 aa  42.7  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2048  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  26.62 
 
 		 168 aa  42.4  0.006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.045391  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>