33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0750 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0750  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 468 aa  905    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1271  polysaccharide biosynthesis protein  33.41 
 
 		 429 aa  169  7e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.958308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3487  polysaccharide biosynthesis protein  32.78 
 
 		 424 aa  162  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0265796 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3796  polysaccharide biosynthesis protein  30.32 
 
 		 478 aa  148  3e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1344  polysaccharide biosynthesis protein  29.76 
 
 		 488 aa  145  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0076  polysaccharide biosynthesis protein  29.88 
 
 		 499 aa  144  3e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.160586  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0079  polysaccharide biosynthesis protein  29.88 
 
 		 499 aa  144  3e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.75242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0743  polysaccharide biosynthesis protein  26.52 
 
 		 509 aa  131  3e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.197884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5347  polysaccharide biosynthesis protein  30.49 
 
 		 422 aa  129  8.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.775837  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3233  polysaccharide biosynthesis protein  27.62 
 
 		 473 aa  128  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2731  polysaccharide biosynthesis protein  28.67 
 
 		 419 aa  126  7e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2289  polysaccharide biosynthesis protein  26.56 
 
 		 484 aa  108  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2428  polysaccharide biosynthesis protein  26.56 
 
 		 484 aa  108  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1706  polysaccharide biosynthesis family protein  26.56 
 
 		 488 aa  107  4e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.974383  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0545  polysaccharide biosynthesis family protein  26.56 
 
 		 484 aa  107  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1873  polysaccharide biosynthesis family protein  26.56 
 
 		 484 aa  107  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1665  polysaccharide biosynthesis family protein  26.56 
 
 		 484 aa  107  4e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.702931  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0753  polysaccharide biosynthesis family protein  26.56 
 
 		 488 aa  107  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1073  polysaccharide biosynthesis protein  25.81 
 
 		 492 aa  107  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.610845 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0694  polysaccharide biosynthesis family protein  26.02 
 
 		 488 aa  105  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.731179  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3973  polysaccharide biosynthesis protein  25.68 
 
 		 488 aa  103  9e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4394  polysaccharide biosynthesis protein  25.68 
 
 		 488 aa  103  9e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.681509  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3556  polysaccharide biosynthesis protein  25.41 
 
 		 488 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.225239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3866  polysaccharide biosynthesis protein  26.88 
 
 		 488 aa  99.4  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.377761  normal  0.957657 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3362  polysaccharide biosynthesis protein  26.88 
 
 		 488 aa  97.1  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2112  polysaccharide biosynthesis protein  26.34 
 
 		 498 aa  95.1  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.306384 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4609  polysaccharide biosynthesis protein  24.88 
 
 		 488 aa  91.7  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.286147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2229  polysaccharide transporter  25.7 
 
 		 488 aa  87.4  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0925528 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1969  polysaccharide biosynthesis protein  24.42 
 
 		 488 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2518  polysaccharide exporter, (PST) family  24.34 
 
 		 486 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0230734 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1791  polysaccharide biosynthesis protein  23.27 
 
 		 504 aa  47  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5012  putative polysaccharide biosynthesis protein  24.64 
 
 		 499 aa  45.8  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1846  polysaccharide biosynthesis protein  29.69 
 
 		 433 aa  43.5  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>