26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0414 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0414  hypothetical protein  100 
 
 		 172 aa  332  1e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0406  hypothetical protein  88.95 
 
 		 172 aa  243  6e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0312  hypothetical protein  67.63 
 
 		 173 aa  213  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0123  hypothetical protein  58.96 
 
 		 171 aa  186  1e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0125  hypothetical protein  60 
 
 		 182 aa  178  4e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.300515 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0305  hypothetical protein  61.63 
 
 		 169 aa  177  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0147  hypothetical protein  51.69 
 
 		 173 aa  166  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1236  hypothetical protein  36.21 
 
 		 162 aa  79.7  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.690863 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6793  hypothetical protein  41.09 
 
 		 161 aa  75.9  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.349132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7532  hypothetical protein  42.03 
 
 		 161 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.661485  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0468  hypothetical protein  40.51 
 
 		 161 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.591914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2292  hypothetical protein  33.33 
 
 		 163 aa  61.6  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.591296 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0837  hypothetical protein  28.4 
 
 		 180 aa  61.2  0.000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2082  hypothetical protein  32.24 
 
 		 169 aa  59.3  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2002  hypothetical protein  32.24 
 
 		 169 aa  59.3  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.45439  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2479  hypothetical protein  35.29 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00521562 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2772  hypothetical protein  39.84 
 
 		 167 aa  54.7  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.12235  normal  0.967769 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0207  hypothetical protein  25.41 
 
 		 176 aa  49.7  0.00002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.143626  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0248  hypothetical protein  32.65 
 
 		 187 aa  48.5  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.717791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3494  hypothetical protein  27.45 
 
 		 161 aa  47.4  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0796  hypothetical protein  25.98 
 
 		 120 aa  46.2  0.0002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2553  hypothetical protein  36.07 
 
 		 158 aa  46.2  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4307  hypothetical protein  30.09 
 
 		 161 aa  45.1  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3262  hypothetical protein  30.71 
 
 		 158 aa  44.7  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2549  hypothetical protein  39.84 
 
 		 167 aa  43.9  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3980  hypothetical protein  32.65 
 
 		 161 aa  42.4  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>