18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0248 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_0248  hypothetical protein  100 
 
 
187 aa  367  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.717791  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0123  hypothetical protein  27.75 
 
 
171 aa  64.3  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0125  hypothetical protein  28.8 
 
 
182 aa  61.2  0.000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.300515 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0147  hypothetical protein  29.27 
 
 
173 aa  61.2  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2292  hypothetical protein  32.86 
 
 
163 aa  58.5  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.591296 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1236  hypothetical protein  31.54 
 
 
162 aa  58.2  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.690863 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0305  hypothetical protein  29.03 
 
 
169 aa  55.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3262  hypothetical protein  32.88 
 
 
158 aa  53.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2553  hypothetical protein  45 
 
 
158 aa  51.2  0.000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2002  hypothetical protein  28.86 
 
 
169 aa  46.6  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.45439  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2082  hypothetical protein  28.86 
 
 
169 aa  46.6  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0837  hypothetical protein  26.63 
 
 
180 aa  46.2  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0037  hypothetical protein  31.71 
 
 
171 aa  45.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.894017  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0312  hypothetical protein  28.48 
 
 
173 aa  45.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3494  hypothetical protein  28.97 
 
 
161 aa  44.7  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0018  hypothetical protein  31.71 
 
 
171 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0052  hypothetical protein  31.71 
 
 
171 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376527  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7532  hypothetical protein  29.69 
 
 
161 aa  44.3  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.661485  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>