25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0305 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0305  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  333  7e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0123  hypothetical protein  59.65 
 
 		 171 aa  204  4e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0125  hypothetical protein  59.43 
 
 		 182 aa  187  5.999999999999999e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.300515 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0147  hypothetical protein  54.6 
 
 		 173 aa  176  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0312  hypothetical protein  53.76 
 
 		 173 aa  157  8e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0406  hypothetical protein  61.05 
 
 		 172 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0414  hypothetical protein  61.63 
 
 		 172 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1236  hypothetical protein  38.73 
 
 		 162 aa  94.4  6e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.690863 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0468  hypothetical protein  39.26 
 
 		 161 aa  81.6  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.591914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7532  hypothetical protein  37.87 
 
 		 161 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.661485  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3494  hypothetical protein  31.25 
 
 		 161 aa  70.5  0.000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6793  hypothetical protein  37.6 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.349132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2772  hypothetical protein  39.23 
 
 		 167 aa  68.2  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.12235  normal  0.967769 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2292  hypothetical protein  32.93 
 
 		 163 aa  67.8  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.591296 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0837  hypothetical protein  35.61 
 
 		 180 aa  67  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3980  hypothetical protein  34.31 
 
 		 161 aa  65.1  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2479  hypothetical protein  34.94 
 
 		 162 aa  61.6  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00521562 
 
 
-
 
NC_004310  BR2082  hypothetical protein  33.08 
 
 		 169 aa  58.9  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4307  hypothetical protein  35.85 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2002  hypothetical protein  33.08 
 
 		 169 aa  58.9  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.45439  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2549  hypothetical protein  39.23 
 
 		 167 aa  55.1  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0248  hypothetical protein  32.45 
 
 		 187 aa  52.8  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.717791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2553  hypothetical protein  35.25 
 
 		 158 aa  49.3  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3262  hypothetical protein  29.03 
 
 		 158 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0796  hypothetical protein  26.13 
 
 		 120 aa  41.2  0.006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>