22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7532 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_7532  hypothetical protein  100 
 
 
161 aa  314  3e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.661485  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6793  hypothetical protein  81.99 
 
 
161 aa  231  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.349132  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2479  hypothetical protein  51.85 
 
 
162 aa  132  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00521562 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2772  hypothetical protein  50.9 
 
 
167 aa  127  9.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.12235  normal  0.967769 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0468  hypothetical protein  52.17 
 
 
161 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.591914  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2549  hypothetical protein  50.89 
 
 
167 aa  110  9e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0123  hypothetical protein  32.74 
 
 
171 aa  75.5  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1236  hypothetical protein  37.72 
 
 
162 aa  75.1  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.690863 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0147  hypothetical protein  34.12 
 
 
173 aa  73.6  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0305  hypothetical protein  37.87 
 
 
169 aa  72  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0125  hypothetical protein  34.83 
 
 
182 aa  70.1  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.300515 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3494  hypothetical protein  31.29 
 
 
161 aa  57.8  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0312  hypothetical protein  35.95 
 
 
173 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3262  hypothetical protein  31.36 
 
 
158 aa  48.5  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2002  hypothetical protein  29.03 
 
 
169 aa  47  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.45439  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2082  hypothetical protein  29.03 
 
 
169 aa  47  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2292  hypothetical protein  26.76 
 
 
163 aa  45.8  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.591296 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0414  hypothetical protein  42.03 
 
 
172 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0406  hypothetical protein  39.66 
 
 
172 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0248  hypothetical protein  29.63 
 
 
187 aa  41.6  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.717791  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0837  hypothetical protein  25.93 
 
 
180 aa  41.6  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0796  hypothetical protein  25.44 
 
 
120 aa  40.8  0.007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>