14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3262 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_3262  hypothetical protein  100 
 
 
158 aa  314  3e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4307  hypothetical protein  30.54 
 
 
161 aa  65.1  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2082  hypothetical protein  30.41 
 
 
169 aa  63.9  0.0000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2002  hypothetical protein  30.41 
 
 
169 aa  63.9  0.0000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.45439  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3980  hypothetical protein  31.67 
 
 
161 aa  63.9  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3494  hypothetical protein  31.11 
 
 
161 aa  50.8  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0837  hypothetical protein  28.78 
 
 
180 aa  50.1  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6793  hypothetical protein  33.06 
 
 
161 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.349132  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0248  hypothetical protein  32.19 
 
 
187 aa  47.4  0.00008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.717791  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0123  hypothetical protein  29.03 
 
 
171 aa  47  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0147  hypothetical protein  31.71 
 
 
173 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7532  hypothetical protein  34.13 
 
 
161 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.661485  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1236  hypothetical protein  25.55 
 
 
162 aa  40.8  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.690863 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0125  hypothetical protein  28.87 
 
 
182 aa  40.4  0.009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.300515 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>