16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2292 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2292  hypothetical protein  100 
 
 
163 aa  320  4e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.591296 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0123  hypothetical protein  28.57 
 
 
171 aa  68.9  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0125  hypothetical protein  28.65 
 
 
182 aa  63.5  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.300515 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0305  hypothetical protein  33.93 
 
 
169 aa  61.6  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0147  hypothetical protein  32.45 
 
 
173 aa  58.9  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0248  hypothetical protein  34.31 
 
 
187 aa  58.2  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.717791  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1236  hypothetical protein  32.39 
 
 
162 aa  57  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.690863 
 
 
-
 
NC_004310  BR2082  hypothetical protein  38.66 
 
 
169 aa  54.3  0.0000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2002  hypothetical protein  38.66 
 
 
169 aa  54.3  0.0000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.45439  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0312  hypothetical protein  30.56 
 
 
173 aa  53.9  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3494  hypothetical protein  27.54 
 
 
161 aa  50.8  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3980  hypothetical protein  32.47 
 
 
161 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0837  hypothetical protein  32.26 
 
 
180 aa  47.8  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2479  hypothetical protein  30.71 
 
 
162 aa  44.7  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00521562 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4307  hypothetical protein  30.65 
 
 
161 aa  44.7  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2772  hypothetical protein  28.06 
 
 
167 aa  42.4  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.12235  normal  0.967769 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>