27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0125 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_0125  hypothetical protein  100 
 
 
182 aa  356  9.999999999999999e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.300515 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0123  hypothetical protein  72.99 
 
 
171 aa  254  4e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0305  hypothetical protein  59.43 
 
 
169 aa  181  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0147  hypothetical protein  54.65 
 
 
173 aa  176  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0312  hypothetical protein  53.98 
 
 
173 aa  151  5e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0414  hypothetical protein  60 
 
 
172 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0406  hypothetical protein  59.43 
 
 
172 aa  139  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1236  hypothetical protein  34.66 
 
 
162 aa  89.4  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.690863 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0468  hypothetical protein  37.36 
 
 
161 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.591914  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6793  hypothetical protein  35.2 
 
 
161 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.349132  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7532  hypothetical protein  35.26 
 
 
161 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.661485  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2292  hypothetical protein  28.65 
 
 
163 aa  66.2  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.591296 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2479  hypothetical protein  34.12 
 
 
162 aa  64.3  0.0000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00521562 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3494  hypothetical protein  29.81 
 
 
161 aa  62.4  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0248  hypothetical protein  27.27 
 
 
187 aa  62  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.717791  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2772  hypothetical protein  36.8 
 
 
167 aa  61.6  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.12235  normal  0.967769 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2549  hypothetical protein  36.26 
 
 
167 aa  60.5  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2002  hypothetical protein  30.22 
 
 
169 aa  52.4  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.45439  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2082  hypothetical protein  30.22 
 
 
169 aa  52.4  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3980  hypothetical protein  33.64 
 
 
161 aa  48.9  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4307  hypothetical protein  33.67 
 
 
161 aa  48.1  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0837  hypothetical protein  32.38 
 
 
180 aa  47  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0796  hypothetical protein  25.66 
 
 
120 aa  45.1  0.0006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1374  hypothetical protein  35.05 
 
 
111 aa  43.1  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2553  hypothetical protein  31.97 
 
 
158 aa  42.7  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3262  hypothetical protein  28.87 
 
 
158 aa  42.4  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0207  hypothetical protein  26.5 
 
 
176 aa  42  0.005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.143626  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>