24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0312 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_0312  hypothetical protein  100 
 
 
173 aa  340  7e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0406  hypothetical protein  65.9 
 
 
172 aa  186  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0414  hypothetical protein  67.63 
 
 
172 aa  186  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0123  hypothetical protein  55.17 
 
 
171 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0125  hypothetical protein  53.98 
 
 
182 aa  162  3e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.300515 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0305  hypothetical protein  53.76 
 
 
169 aa  160  6e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0147  hypothetical protein  43.58 
 
 
173 aa  136  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1236  hypothetical protein  36.84 
 
 
162 aa  82  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.690863 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6793  hypothetical protein  37.88 
 
 
161 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.349132  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0468  hypothetical protein  42.75 
 
 
161 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.591914  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3494  hypothetical protein  34.07 
 
 
161 aa  61.2  0.000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2772  hypothetical protein  39.1 
 
 
167 aa  60.5  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.12235  normal  0.967769 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2292  hypothetical protein  32.65 
 
 
163 aa  59.7  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.591296 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7532  hypothetical protein  35.95 
 
 
161 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.661485  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2479  hypothetical protein  34.29 
 
 
162 aa  55.1  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00521562 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0248  hypothetical protein  33.64 
 
 
187 aa  52  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.717791  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2549  hypothetical protein  36.16 
 
 
167 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0837  hypothetical protein  31.58 
 
 
180 aa  46.2  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2002  hypothetical protein  32.81 
 
 
169 aa  45.4  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.45439  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2082  hypothetical protein  32.81 
 
 
169 aa  45.4  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3980  hypothetical protein  29.52 
 
 
161 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0796  hypothetical protein  26.53 
 
 
120 aa  42.7  0.003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3262  hypothetical protein  30.36 
 
 
158 aa  41.6  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4307  hypothetical protein  28.97 
 
 
161 aa  41.6  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>