17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3882 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3882  phytanoyl-CoA dioxygenase  100 
 
 		 316 aa  652    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6528  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.99 
 
 		 283 aa  61.6  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1088  phytanoyl-CoA dioxygenase  36.24 
 
 		 254 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.326612 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2701  phytanoyl-CoA dioxygenase  32.85 
 
 		 248 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.963654 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3472  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.64 
 
 		 301 aa  52.8  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0454164  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10130  dioxygenase  36.64 
 
 		 256 aa  49.7  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00000187903  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1961  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.72 
 
 		 260 aa  47.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00281638  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1714  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.79 
 
 		 293 aa  48.1  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.635994  normal  0.315835 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1259  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  23.35 
 
 		 253 aa  47.8  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199096 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6323  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.31 
 
 		 239 aa  47  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0569  hypothetical protein  32.35 
 
 		 284 aa  46.2  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3392  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24 
 
 		 260 aa  45.8  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.325628 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1544  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.66 
 
 		 303 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.149771  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6285  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.66 
 
 		 303 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142673  normal  0.594182 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6945  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.21 
 
 		 303 aa  43.5  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.979271  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0673  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.95 
 
 		 280 aa  43.1  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0790  mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin biosynthesis protein  23.33 
 
 		 300 aa  42.4  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>