47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3633 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3633  membrane antigen  100 
 
 		 171 aa  347  3e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.585551  normal  0.0231939 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0390  hypothetical protein  66.08 
 
 		 183 aa  234  4e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0381  membrane antigen, putative  68.9 
 
 		 182 aa  230  7.000000000000001e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0329  putative membrane antigen  68.9 
 
 		 182 aa  230  7.000000000000001e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3152  hypothetical protein  65.62 
 
 		 182 aa  216  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.329598 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3603  putative periplasmic protein  61.4 
 
 		 178 aa  216  2e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.227329 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1397  hypothetical protein  65.62 
 
 		 182 aa  214  5.9999999999999996e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00920519  normal  0.0195288 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3803  hypothetical protein  63.86 
 
 		 191 aa  211  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.682975  normal  0.0919462 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1113  hypothetical protein  63.12 
 
 		 181 aa  210  7e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.361663  normal  0.175821 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1957  hypothetical protein  63.12 
 
 		 182 aa  209  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.145288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4285  membrane antigen  64.46 
 
 		 181 aa  204  4e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.204987  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2035  antigen, putative  61.45 
 
 		 183 aa  202  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2126  hypothetical protein  62.73 
 
 		 183 aa  202  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.813368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2233  hypothetical protein  62.73 
 
 		 183 aa  201  5e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.894017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1068  hypothetical protein  62.11 
 
 		 183 aa  201  5e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.353182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5868  hypothetical protein  62.73 
 
 		 183 aa  201  5e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2209  hypothetical protein  62.73 
 
 		 183 aa  201  5e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2247  hypothetical protein  62.73 
 
 		 183 aa  200  6e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1740  putative antigen  62.11 
 
 		 206 aa  200  8e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.63433  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0014  putative antigen  62.11 
 
 		 183 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0606  hypothetical protein  62.11 
 
 		 183 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.205174  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0508  hypothetical protein  62.11 
 
 		 183 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0914  putative antigen  62.11 
 
 		 182 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.237856  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0881  putative antigen  62.11 
 
 		 183 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1921  19 kDa periplasmic protein  62.11 
 
 		 183 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5537  hypothetical protein  61.49 
 
 		 183 aa  197  5e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0432  ProP protein  53.33 
 
 		 173 aa  167  9e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000293439  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0525  hypothetical protein  50.3 
 
 		 173 aa  162  1.0000000000000001e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.155512  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0764  C4-dicarboxylate-binding periplasmic protein  55.19 
 
 		 173 aa  162  2.0000000000000002e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.204377  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1169  19 kDa periplasmic protein  51.5 
 
 		 173 aa  162  3e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2140  hypothetical protein  52.83 
 
 		 175 aa  160  6e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2133  hypothetical protein  52.83 
 
 		 175 aa  160  6e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0704284 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2251  hypothetical protein  52.83 
 
 		 175 aa  160  6e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2808  hypothetical protein  50.33 
 
 		 176 aa  159  2e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1784  Ferrous iron transport protein  51.57 
 
 		 181 aa  155  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.86089  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3505  membrane antigen  45.66 
 
 		 183 aa  156  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.147958 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1386  hypothetical protein  51.57 
 
 		 175 aa  155  3e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1831  hypothetical protein  48.54 
 
 		 179 aa  153  1e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2019  hypothetical protein  48.54 
 
 		 179 aa  153  1e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1650  hypothetical protein  48.54 
 
 		 179 aa  153  1e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0449  hypothetical protein  50.62 
 
 		 173 aa  151  5e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0547606  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1511  pathogen-specific surface antigen, putative  48.17 
 
 		 208 aa  119  3e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00229919  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1355  hypothetical protein  41.51 
 
 		 173 aa  115  3e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.957236 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1254  Fe2+ high-affinity transport protein  44.51 
 
 		 227 aa  102  2e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0161  pathogen-specific surface antigen family protein  40.52 
 
 		 214 aa  101  6e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.676724 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2253  hypothetical protein  27.87 
 
 		 219 aa  41.2  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.847078  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1485  hypothetical protein  39.68 
 
 		 371 aa  40.8  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>