153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0650 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0650  hypothetical protein  100 
 
 		 117 aa  234  4e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4598  transposase IS66  65.18 
 
 		 510 aa  147  6e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.864978 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6322  transposase IS66  62.28 
 
 		 505 aa  143  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8372  transposase IS66  62.28 
 
 		 505 aa  143  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4341  transposase IS66  62.28 
 
 		 505 aa  143  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4053  hypothetical protein  62.5 
 
 		 134 aa  103  6e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.58003  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0185  IS66 family transposase  41.07 
 
 		 520 aa  75.5  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1223  IS66 family transposase  41.07 
 
 		 520 aa  75.5  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4877  transposase IS66  39.1 
 
 		 529 aa  73.9  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386958  normal  0.659358 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0693  transposase  36.69 
 
 		 537 aa  70.1  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0556  IS66 family orf3  39.32 
 
 		 523 aa  62.4  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.433641  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0522  IS66 family element, orf3  39.32 
 
 		 523 aa  62.4  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.615968  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3983  transposase IS66  38.89 
 
 		 461 aa  61.2  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3724  hypothetical protein  41.41 
 
 		 527 aa  60.5  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2470  ISAfe4, transposase orf3  39.64 
 
 		 545 aa  58.2  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1706  ISAfe4, transposase orf3  41.44 
 
 		 545 aa  58.2  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.249951  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0266  transposase IS66  39.64 
 
 		 545 aa  58.2  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1756  transposase IS66  39.64 
 
 		 545 aa  58.2  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.970499 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2093  transposase IS66  39.64 
 
 		 545 aa  58.2  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3307  transposase IS66  34.71 
 
 		 341 aa  57.4  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.448509 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1326  transposase IS66  40.54 
 
 		 545 aa  55.8  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0424374 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5514  transposase IS66  32.76 
 
 		 253 aa  52.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.90828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6097  transposase IS66  32.76 
 
 		 253 aa  52.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6364  transposase IS66  32.76 
 
 		 524 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.39651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1222  transposase IS66  32.76 
 
 		 253 aa  52.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21696  normal  0.0493097 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4328  transposase IS66  34.75 
 
 		 524 aa  51.2  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4686  transposase IS66  34.75 
 
 		 524 aa  51.2  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3169  putative IS66 transposase, TnpC  33.82 
 
 		 226 aa  50.8  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.180033  normal  0.755183 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2744  transposase IS66  34.75 
 
 		 524 aa  51.2  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6857  transposase IS66  33.09 
 
 		 520 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.130524  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1840  transposase IS66  37.23 
 
 		 143 aa  50.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4818  hypothetical protein  40.91 
 
 		 182 aa  50.4  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.192973 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4817  transposase IS66  40.91 
 
 		 533 aa  49.7  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.171914 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5015  transposase IS66  34.65 
 
 		 549 aa  50.1  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5560  transposase IS66  37.7 
 
 		 516 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.438701 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4165  transposase IS66  39.13 
 
 		 523 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.699531  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4976  transposase IS66  32.61 
 
 		 531 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000420547  normal  0.71393 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9623  transposase  36.08 
 
 		 539 aa  48.5  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.264971  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0171  transposase IS66  39.13 
 
 		 523 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0431  transposase IS66  39.13 
 
 		 523 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0146215 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0915  transposase IS66  39.13 
 
 		 523 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.137432 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1419  transposase IS66  39.13 
 
 		 523 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1809  transposase IS66  39.13 
 
 		 323 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.247859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3516  IS66 Orf2 family protein  39.13 
 
 		 513 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.578775  normal  0.957908 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3715  IS66 Orf2 family protein  39.13 
 
 		 523 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3722  hypothetical protein  39.13 
 
 		 523 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3763  hypothetical protein  39.13 
 
 		 523 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.727828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4305  hypothetical protein  39.13 
 
 		 523 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4308  hypothetical protein  39.13 
 
 		 523 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0659  transposase IS66  35.05 
 
 		 514 aa  48.5  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2707  transposase  28.97 
 
 		 495 aa  47.8  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0270  transposase  28.97 
 
 		 495 aa  47.8  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.214803  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2753  transposase  28.97 
 
 		 495 aa  47.8  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0335  transposase  28.97 
 
 		 495 aa  47.8  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.137589  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2598  transposase  28.97 
 
 		 495 aa  47.8  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0928  transposase  28.97 
 
 		 495 aa  47.8  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.977799  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1061  transposase  28.97 
 
 		 495 aa  47.8  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.336401  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2114  transposase  28.97 
 
 		 495 aa  47.8  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2250  transposase  28.97 
 
 		 495 aa  47.8  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.751402  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0515  transposase  28.97 
 
 		 495 aa  47.4  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0175  transposase  28.97 
 
 		 495 aa  47.4  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0219  transposase  28.97 
 
 		 495 aa  47.4  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.806088  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0236  transposase  28.97 
 
 		 495 aa  47.4  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0243  transposase  28.97 
 
 		 495 aa  47.4  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0751  transposase  28.97 
 
 		 495 aa  47.4  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0470  transposase  28.97 
 
 		 495 aa  47.4  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0031  transposase  28.97 
 
 		 495 aa  47.4  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2684  transposase  28.97 
 
 		 495 aa  47.4  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0678358  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2953  transposase  28.97 
 
 		 495 aa  47.4  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0023  transposase  28.97 
 
 		 495 aa  47.4  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2611  transposase  28.97 
 
 		 495 aa  47.4  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0848316  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0098  transposase  28.97 
 
 		 495 aa  47.4  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0069  transposase  28.97 
 
 		 495 aa  47.4  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0046  transposase  28.97 
 
 		 495 aa  47.4  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.539045  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2943  transposase  28.97 
 
 		 495 aa  47.4  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0144  transposase  28.97 
 
 		 495 aa  47.4  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.201351  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0214  transposase  28.97 
 
 		 495 aa  47.4  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0291  transposase  28.97 
 
 		 495 aa  47.4  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0437  transposase  28.97 
 
 		 495 aa  47.4  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0783  transposase  28.97 
 
 		 495 aa  47.4  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00157857  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0811  transposase  28.97 
 
 		 495 aa  47.4  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.973056  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1205  transposase  28.97 
 
 		 495 aa  47.4  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1280  transposase  28.97 
 
 		 495 aa  47.4  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.653734  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1293  transposase  28.97 
 
 		 495 aa  47.4  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.185567  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1417  transposase  28.97 
 
 		 495 aa  47.4  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1442  transposase  28.97 
 
 		 495 aa  47.4  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.612647  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1576  transposase  28.97 
 
 		 495 aa  47.4  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1656  transposase  28.97 
 
 		 495 aa  47.4  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.413998  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1664  transposase  28.97 
 
 		 495 aa  47.4  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.17167  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1672  transposase  28.97 
 
 		 495 aa  47.4  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.586592  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1747  transposase  28.97 
 
 		 495 aa  47.4  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1780  transposase  28.97 
 
 		 495 aa  47.4  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.175929  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1930  transposase  28.97 
 
 		 495 aa  47.4  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.897519  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2042  transposase  28.97 
 
 		 495 aa  47.4  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2163  transposase  28.97 
 
 		 495 aa  47.4  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.94613  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2178  transposase  28.97 
 
 		 495 aa  47.4  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2262  transposase  28.97 
 
 		 495 aa  47.4  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.630405  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2264  transposase  28.97 
 
 		 495 aa  47.8  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.619364  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2404  transposase  28.97 
 
 		 495 aa  47.4  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2486  transposase  28.97 
 
 		 495 aa  47.4  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.267041  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>