84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2043 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_2043  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
155 aa  323  4.0000000000000003e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3347  GCN5-related N-acetyltransferase  96.77 
 
 
155 aa  314  4e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.351306  normal  0.14056 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1088  GCN5-related N-acetyltransferase  31.47 
 
 
151 aa  84.7  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1463  GCN5-related N-acetyltransferase  29.05 
 
 
152 aa  73.9  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0158  GCN5-related N-acetyltransferase  24.82 
 
 
143 aa  52  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1772  GCN5-related N-acetyltransferase  23.65 
 
 
145 aa  50.8  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2440  GCN5-related N-acetyltransferase  33.71 
 
 
154 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.102944 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2434  GCN5-related N-acetyltransferase  33.71 
 
 
154 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2393  GCN5-related N-acetyltransferase  33.71 
 
 
154 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0898256  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3736  GCN5-related N-acetyltransferase  29.03 
 
 
252 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.944087  normal  0.406505 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0798  GCN5-related N-acetyltransferase  24.54 
 
 
174 aa  48.5  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.631657  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0929  GCN5-related N-acetyltransferase  31.63 
 
 
186 aa  48.1  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.568206 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2342  GCN5-related N-acetyltransferase  31.07 
 
 
180 aa  48.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0987  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  26.15 
 
 
150 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.229607  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0125  GCN5-related N-acetyltransferase  29.46 
 
 
158 aa  47.8  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.328522 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2026  GCN5-related N-acetyltransferase  27.66 
 
 
327 aa  47.8  0.00006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0933  GCN5-related N-acetyltransferase  30.56 
 
 
204 aa  47  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0955  GCN5-related N-acetyltransferase  27.93 
 
 
204 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.830489  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0992  GCN5-related N-acetyltransferase  27.93 
 
 
191 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.552024 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06850  acetyltransferase  25.23 
 
 
154 aa  46.2  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1392  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.62 
 
 
148 aa  46.2  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000164567  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0856  GCN5-related N-acetyltransferase  27.27 
 
 
166 aa  46.2  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0597402 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2923  GCN5-related N-acetyltransferase  31.78 
 
 
150 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.972498  normal  0.478463 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01970  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  25.69 
 
 
151 aa  45.4  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.638695  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0058  GCN5-related N-acetyltransferase  25.16 
 
 
330 aa  45.4  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3522  GCN5-related N-acetyltransferase  25.45 
 
 
177 aa  45.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.395966  normal  0.175293 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07340  predicted acyltransferase  26.09 
 
 
161 aa  45.4  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.633713  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0267  GCN5-related N-acetyltransferase  27.27 
 
 
181 aa  44.7  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00122912 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0517  hypothetical protein  27.56 
 
 
893 aa  44.3  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7075  GCN5-related N-acetyltransferase  31.68 
 
 
153 aa  44.3  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1901  GCN5-related N-acetyltransferase  32.79 
 
 
170 aa  44.3  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2525  GCN5-related N-acetyltransferase  27.66 
 
 
188 aa  44.3  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0768  GCN5-related N-acetyltransferase  24.14 
 
 
155 aa  44.3  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.633559 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07490  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.12 
 
 
175 aa  43.9  0.0007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106277  normal  0.121236 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0828  GCN5-related N-acetyltransferase  22.43 
 
 
147 aa  43.9  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.271044 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3585  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.28 
 
 
160 aa  43.9  0.0009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1274  Phosphinothricin acetyltransferase  28.87 
 
 
168 aa  43.5  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.768034  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3266  GCN5-related N-acetyltransferase  29.55 
 
 
158 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3131  putative phosphinothricin N-acetyltransferase  30.1 
 
 
190 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1411  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000201819  hitchhiker  0.000645315 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0913  GCN5-related N-acetyltransferase  27.91 
 
 
169 aa  43.5  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5125  GCN5-related N-acetyltransferase  30.56 
 
 
158 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.281368 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3210  aminoglycoside N6'-acetyltransferase  29.91 
 
 
150 aa  43.5  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.938022  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3647  GCN5-related N-acetyltransferase  28.37 
 
 
182 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3851  GCN5-related N-acetyltransferase  27.71 
 
 
154 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.619468  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4724  GCN5-related N-acetyltransferase  28.37 
 
 
182 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0556271 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4360  acetyltransferase  30.43 
 
 
151 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0635427  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2409  GCN5-related N-acetyltransferase  25.25 
 
 
143 aa  43.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4513  acetyltransferase  30.43 
 
 
151 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.866395  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2917  GCN5-related N-acetyltransferase  26.04 
 
 
158 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4866  acetyltransferase  30.43 
 
 
151 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2424  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  23.08 
 
 
148 aa  42.7  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2134  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  23.08 
 
 
148 aa  42.4  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0309  GCN5-related N-acetyltransferase  26.79 
 
 
169 aa  42  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5542  GCN5-related N-acetyltransferase  27.03 
 
 
152 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.774443 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0983  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  26.73 
 
 
150 aa  42.4  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.570176  normal  0.0327101 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1048  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  25.74 
 
 
150 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.070791  hitchhiker  0.00513124 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2457  GCN5-related N-acetyltransferase  29.9 
 
 
167 aa  41.6  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0451  mycothiol biosynthesis acetyltransferase  25.84 
 
 
295 aa  41.6  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.237261  normal  0.21321 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1753  hypothetical protein  30 
 
 
154 aa  41.6  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.456587 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0594  mycothiol biosynthesis acetyltransferase  26.14 
 
 
297 aa  42  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22560  predicted acyltransferase  27.54 
 
 
105 aa  41.6  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1891  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  29.13 
 
 
158 aa  41.6  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.304627 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0549  GCN5-related N-acetyltransferase  24.64 
 
 
146 aa  41.6  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2631  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  25.87 
 
 
153 aa  41.6  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0709643  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4023  GCN5-related N-acetyltransferase  29.41 
 
 
186 aa  41.2  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.210755  normal  0.806566 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3437  GCN5-related N-acetyltransferase  29.73 
 
 
206 aa  40.8  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1820  GCN5-related N-acetyltransferase  26.76 
 
 
148 aa  41.2  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.209618  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4113  GCN5-related N-acetyltransferase  26.8 
 
 
158 aa  40.8  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4235  GCN5-related N-acetyltransferase  23.57 
 
 
162 aa  40.8  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.815435  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3264  putative acetyltransferase  25 
 
 
150 aa  40.8  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.172457  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2383  GCN5-related N-acetyltransferase  28.75 
 
 
185 aa  40.4  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0884493  normal  0.147497 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0101  GCN5-related N-acetyltransferase  29.57 
 
 
193 aa  40.4  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0581786  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2328  GCN5-related N-acetyltransferase  22.55 
 
 
146 aa  40.8  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000658467  normal  0.508858 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1154  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
186 aa  40.4  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0181286  normal  0.493902 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0694  GCN5-related N-acetyltransferase  29.29 
 
 
166 aa  40.4  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0639  GCN5-related N-acetyltransferase  30.68 
 
 
186 aa  40.4  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0323  GCN5-related N-acetyltransferase  37.04 
 
 
282 aa  40.4  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0621  GCN5-related N-acetyltransferase  24.39 
 
 
294 aa  40.4  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3326  GCN5-related N-acetyltransferase  24.18 
 
 
166 aa  40.4  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3272  GCN5-related N-acetyltransferase  36.84 
 
 
210 aa  40.4  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0944  GCN5-related N-acetyltransferase  23.33 
 
 
174 aa  40.4  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.884644  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1640  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 
176 aa  40.4  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.883223 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2720  GCN5-related N-acetyltransferase  24.49 
 
 
156 aa  40.4  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>