12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1947 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1947  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  329  1e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.222699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1944  hypothetical protein  47.17 
 
 		 176 aa  120  9e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.253579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2933  conserved hypothetical protein-like protein  30.54 
 
 		 175 aa  101  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1586  conserved hypothetical protein  28.57 
 
 		 153 aa  61.2  0.000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.404669  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2213  hypothetical protein  28.57 
 
 		 153 aa  61.2  0.000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1978  hypothetical protein  29.55 
 
 		 290 aa  61.2  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000120244  normal  0.18004 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0989  hypothetical protein  28.57 
 
 		 173 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.967035  normal  0.180988 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1842  hypothetical protein  24.69 
 
 		 163 aa  57.8  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0360  lipoprotein  25.53 
 
 		 272 aa  51.2  0.000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.142396  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4681  hypothetical protein  25.61 
 
 		 249 aa  48.1  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0150  lipoprotein  24.66 
 
 		 251 aa  47.4  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2418  hypothetical protein  21.65 
 
 		 163 aa  42  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>