47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3723 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_3723    100 
 
 		 237 bp  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3721  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  91.98 
 
 		 1248 bp  311  5e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1661  ribonucleoside-diphosphate reductase, beta subunit  88.61 
 
 		 1248 bp  248  6e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4295  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  86.94 
 
 		 1251 bp  210  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.706948  normal  0.958774 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1209  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  86.49 
 
 		 1248 bp  202  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1191  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  86.24 
 
 		 1251 bp  194  8e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.149701  normal  0.511312 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4238  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  85.14 
 
 		 1251 bp  178  4e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1177  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  84.68 
 
 		 1251 bp  170  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.726447  normal  0.0669106 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33300  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  84.69 
 
 		 1251 bp  161  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3152  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  83.94 
 
 		 1251 bp  155  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.284704 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49470  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  84.39 
 
 		 1248 bp  153  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0051562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4225  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  82.93 
 
 		 1248 bp  129  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0667  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  81.67 
 
 		 1263 bp  95.6  5e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0871304  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2614  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  95.45 
 
 		 1227 bp  71.9  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0975444  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1441  Ribonucleoside-diphosphate reductase  85.54 
 
 		 1239 bp  69.9  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2638  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  87.5 
 
 		 1224 bp  63.9  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2940  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  87.5 
 
 		 1185 bp  63.9  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.100724  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3274  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  92.68 
 
 		 1212 bp  58  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3511  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  92.68 
 
 		 1212 bp  58  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3473  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  92.68 
 
 		 1212 bp  58  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.281363  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1289  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  92.68 
 
 		 1212 bp  58  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2509  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  92.68 
 
 		 1053 bp  58  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311533  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3510  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  92.68 
 
 		 1131 bp  58  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0430  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  92.68 
 
 		 1212 bp  58  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.897908  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1154  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  92.68 
 
 		 1134 bp  58  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4730    86.67 
 
 		 168 bp  56  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.148976  normal  0.209685 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2804  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  90.48 
 
 		 1203 bp  52  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.276973  normal  0.329365 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0565  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  90.24 
 
 		 1212 bp  50.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.218324  hitchhiker  0.000257704 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2636  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  90.24 
 
 		 1209 bp  50.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.514202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3046  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  90.24 
 
 		 1209 bp  50.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3435  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  90.24 
 
 		 1248 bp  50.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00871681  normal  0.016373 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3680  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  90.24 
 
 		 1212 bp  50.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0523  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  90.24 
 
 		 1212 bp  50.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.165447 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0523  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  90.24 
 
 		 1236 bp  50.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.885023 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2788  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  90.24 
 
 		 1191 bp  50.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.432936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1500  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  90.24 
 
 		 1092 bp  50.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.656036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3087  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  88.89 
 
 		 1188 bp  50.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0113  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  90.24 
 
 		 1149 bp  50.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.967769  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0498  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  90.24 
 
 		 1212 bp  50.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.134097  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0596  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  90.24 
 
 		 1149 bp  50.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.636491  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0383  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  85.71 
 
 		 1209 bp  48.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0181778 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2103  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  100 
 
 		 1065 bp  48.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197754 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0955  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  85.71 
 
 		 1176 bp  48.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3386  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  88.64 
 
 		 1164 bp  48.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1009  Ribonucleoside-diphosphate reductase  96.43 
 
 		 1197 bp  48.1  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.746585  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1495  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  88.64 
 
 		 1200 bp  48.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.730303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0863  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  91.43 
 
 		 1164 bp  46.1  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.661297  normal  0.0191751 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>