More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_0596 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2943  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  87.14 
 
 
396 aa  647    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0383  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  88.72 
 
 
402 aa  639    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0181778 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3213  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  87.54 
 
 
403 aa  648    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.126363  normal  0.0105971 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0565  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  100 
 
 
403 aa  801    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.218324  hitchhiker  0.000257704 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0955  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  88.43 
 
 
391 aa  640    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0430  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  94.03 
 
 
403 aa  746    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.897908  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2804  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  85.64 
 
 
400 aa  664    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.276973  normal  0.329365 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3473  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  94.03 
 
 
403 aa  746    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.281363  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0523  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  98.43 
 
 
403 aa  792    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.165447 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3435  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  88.72 
 
 
415 aa  726    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00871681  normal  0.016373 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0205  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  80.89 
 
 
394 aa  650    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000182543  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2509  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  96.02 
 
 
350 aa  706    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311533  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2940  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  83.51 
 
 
394 aa  665    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.100724  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3510  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  94.46 
 
 
376 aa  738    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3680  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  99.21 
 
 
403 aa  796    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2469  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  88.43 
 
 
408 aa  640    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00438288  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1154  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  94.99 
 
 
377 aa  747    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3348  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  82.7 
 
 
400 aa  648    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.443517  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3046  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  86.92 
 
 
402 aa  663    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1106  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  88.24 
 
 
406 aa  645    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00154398  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0523  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  88.72 
 
 
411 aa  723    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.885023 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2636  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  92.58 
 
 
402 aa  664    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.514202  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3087  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  88.76 
 
 
395 aa  663    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0113  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  100 
 
 
382 aa  801    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.967769  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2638  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  89.38 
 
 
407 aa  713    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1500  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  86.65 
 
 
363 aa  645    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.656036  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2788  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  98.69 
 
 
396 aa  793    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.432936  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0498  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  98.43 
 
 
403 aa  792    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.134097  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3511  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  94.03 
 
 
403 aa  746    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1289  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  94.03 
 
 
403 aa  746    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3274  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  94.03 
 
 
403 aa  746    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0596  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  100 
 
 
382 aa  801    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.636491  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0223  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  85.71 
 
 
394 aa  647    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000260212  normal  0.80957 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0863  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  89.32 
 
 
387 aa  642    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.661297  normal  0.0191751 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3386  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  81.82 
 
 
387 aa  642    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3633  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  87.14 
 
 
396 aa  647    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0677479  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1975  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  86.09 
 
 
376 aa  627  1e-178  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0400777  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1495  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  76.88 
 
 
399 aa  617  1e-175  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.730303  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2639  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  75.96 
 
 
380 aa  585  1e-166  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.118987  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2265  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  75.96 
 
 
374 aa  585  1e-166  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.247043  hitchhiker  0.00000000794033 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4674  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  90.54 
 
 
328 aa  572  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1441  Ribonucleoside-diphosphate reductase  71.91 
 
 
412 aa  550  1e-155  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2614  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  74.18 
 
 
408 aa  545  1e-154  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0975444  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2528  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  72.78 
 
 
412 aa  536  1e-151  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.506084  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1637  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  68.82 
 
 
403 aa  529  1e-149  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0261483  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1737  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  69.82 
 
 
401 aa  526  1e-148  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0435  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  69.82 
 
 
401 aa  526  1e-148  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1739  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  70.41 
 
 
367 aa  526  1e-148  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1739  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  67.6 
 
 
367 aa  526  1e-148  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1661  ribonucleoside-diphosphate reductase, beta subunit  67.74 
 
 
415 aa  522  1e-147  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4295  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  68.04 
 
 
416 aa  523  1e-147  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.706948  normal  0.958774 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1177  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  67.74 
 
 
416 aa  518  1e-146  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.726447  normal  0.0669106 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4225  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  67.45 
 
 
415 aa  520  1e-146  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3721  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  67.45 
 
 
415 aa  520  1e-146  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1209  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  67.74 
 
 
415 aa  520  1e-146  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33300  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  68.04 
 
 
416 aa  520  1e-146  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4238  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  67.74 
 
 
416 aa  518  1e-146  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1191  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  67.74 
 
 
416 aa  519  1e-146  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.149701  normal  0.511312 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49470  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  67.45 
 
 
415 aa  520  1e-146  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0051562  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3152  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  67.74 
 
 
416 aa  520  1e-146  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.284704 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2459  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  69.14 
 
 
423 aa  517  1.0000000000000001e-145  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.955756  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0667  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  67.46 
 
 
420 aa  506  9.999999999999999e-143  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0871304  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3002  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  66.86 
 
 
354 aa  503  1e-141  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.371001  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2887  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  65.98 
 
 
391 aa  501  1e-141  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.395919  normal  0.0685019 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2702  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  64.82 
 
 
369 aa  504  1e-141  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4609  Ribonucleoside-diphosphate reductase  63.97 
 
 
360 aa  499  1e-140  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.384071 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3664  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  65.68 
 
 
416 aa  498  1e-140  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1009  Ribonucleoside-diphosphate reductase  60.52 
 
 
398 aa  488  1e-137  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.746585  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3518  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  63.1 
 
 
386 aa  491  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0483754 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16400  ribonucleotide reductase, beta subunit  64.2 
 
 
349 aa  489  1e-137  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.876136  normal  0.394425 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3158  Ribonucleoside-diphosphate reductase  64.2 
 
 
358 aa  488  1e-137  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.380157  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2638  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  63.06 
 
 
373 aa  484  1e-135  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.66937  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2103  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  63.29 
 
 
354 aa  475  1e-133  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.197754 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0430  Ribonucleoside-diphosphate reductase  61.27 
 
 
347 aa  444  1e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0215  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  59.82 
 
 
346 aa  438  9.999999999999999e-123  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0959296  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2574  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  59.29 
 
 
342 aa  429  1e-119  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2622  Ribonucleoside-diphosphate reductase  58.88 
 
 
353 aa  420  1e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00719466  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2337  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  49.85 
 
 
330 aa  348  1e-94  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2656  Ribonucleoside-diphosphate reductase  48.47 
 
 
330 aa  337  1.9999999999999998e-91  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.840275  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3460  amino acid adenylation  41.05 
 
 
368 aa  278  1e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00848931 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3856  ribonucleoside-diphosphate reductase  40.68 
 
 
352 aa  271  1e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.468759  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1715  Ribonucleoside-diphosphate reductase  39.34 
 
 
364 aa  258  1e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.957793  normal  0.0111265 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1725  ribonucleoside-diphosphate reductase  36.09 
 
 
348 aa  216  5.9999999999999996e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21930  ribonucleotide reductase, beta subunit  35.19 
 
 
365 aa  206  6e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.113756  normal  0.84337 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2041  Ribonucleoside-diphosphate reductase  35.19 
 
 
331 aa  205  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.202371  normal  0.0413781 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4876  ribonucleoside-diphosphate reductase  34.46 
 
 
350 aa  203  4e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0340967 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4387  ribonucleoside-diphosphate reductase  33.54 
 
 
350 aa  199  5e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.86185  normal  0.405922 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6268  Ribonucleoside-diphosphate reductase  33.54 
 
 
331 aa  189  5e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0689361 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5565  Ribonucleoside-diphosphate reductase  31.64 
 
 
338 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0013  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  30.27 
 
 
340 aa  177  2e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0738  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  30.86 
 
 
338 aa  177  2e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00633879  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0207  Ribonucleoside-diphosphate reductase  30.7 
 
 
339 aa  175  9.999999999999999e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2670  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  32.63 
 
 
344 aa  171  2e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2355  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  32.63 
 
 
344 aa  171  2e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0052  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  28.81 
 
 
353 aa  169  9e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0950688  normal  0.0372679 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0505  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  30.84 
 
 
319 aa  168  1e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.350421 
 
 
-
 
NC_002978  WD0212  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  31.25 
 
 
329 aa  167  2.9999999999999998e-40  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0119093  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0029  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  30.87 
 
 
340 aa  164  3e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000949111  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0297  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  29.82 
 
 
340 aa  163  4.0000000000000004e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.382781  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1600  Ribonucleoside-diphosphate reductase  31.25 
 
 
369 aa  163  4.0000000000000004e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0974461  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>