296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0863 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2636  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  77.86 
 
 
402 aa  650    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.514202  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0223  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  78.05 
 
 
394 aa  646    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000260212  normal  0.80957 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3473  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  77.78 
 
 
403 aa  647    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.281363  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2638  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  76.77 
 
 
407 aa  640    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2804  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  78.66 
 
 
400 aa  649    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.276973  normal  0.329365 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3213  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  90.28 
 
 
403 aa  679    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.126363  normal  0.0105971 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0565  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  79.4 
 
 
403 aa  655    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.218324  hitchhiker  0.000257704 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0430  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  77.78 
 
 
403 aa  647    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.897908  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2509  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  87.28 
 
 
350 aa  642    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311533  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2940  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  79.7 
 
 
394 aa  659    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.100724  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3510  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  87.28 
 
 
376 aa  643    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3680  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  79.21 
 
 
403 aa  656    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3046  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  78.27 
 
 
402 aa  648    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1495  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  83.21 
 
 
399 aa  685    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.730303  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1154  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  87.86 
 
 
377 aa  646    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3348  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  85 
 
 
400 aa  687    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.443517  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1106  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  83.25 
 
 
406 aa  693    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00154398  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0523  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  77.62 
 
 
411 aa  653    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.885023 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3087  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  79.75 
 
 
395 aa  656    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3435  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  77.37 
 
 
415 aa  652    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00871681  normal  0.016373 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1289  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  77.78 
 
 
403 aa  647    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0113  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  87.14 
 
 
382 aa  650    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.967769  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0955  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  87.72 
 
 
391 aa  694    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0383  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  92.9 
 
 
402 aa  668    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0181778 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0498  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  79.65 
 
 
403 aa  656    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.134097  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3511  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  77.78 
 
 
403 aa  647    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0523  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  79.65 
 
 
403 aa  656    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.165447 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0205  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  79.19 
 
 
394 aa  657    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000182543  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0596  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  87.14 
 
 
382 aa  650    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.636491  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3274  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  77.78 
 
 
403 aa  647    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1500  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  92.07 
 
 
363 aa  680    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.656036  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2943  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  89.39 
 
 
396 aa  730    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0863  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  100 
 
 
387 aa  813    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.661297  normal  0.0191751 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3386  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  86.56 
 
 
387 aa  703    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3633  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  89.39 
 
 
396 aa  730    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0677479  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2788  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  87.43 
 
 
396 aa  651    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.432936  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2469  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  82.85 
 
 
408 aa  616  1e-175  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00438288  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1975  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  82.79 
 
 
376 aa  607  9.999999999999999e-173  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0400777  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2639  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  76.85 
 
 
380 aa  568  1e-161  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.118987  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2265  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  76.85 
 
 
374 aa  567  1e-160  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.247043  hitchhiker  0.00000000794033 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4674  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  84.92 
 
 
328 aa  554  1e-156  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2614  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  63.24 
 
 
408 aa  539  9.999999999999999e-153  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0975444  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1441  Ribonucleoside-diphosphate reductase  72.7 
 
 
412 aa  536  1e-151  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1737  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  69.44 
 
 
401 aa  525  1e-148  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0435  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  69.44 
 
 
401 aa  525  1e-148  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1637  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  60.88 
 
 
403 aa  521  1e-147  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0261483  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1739  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  70.03 
 
 
367 aa  522  1e-147  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1739  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  70.03 
 
 
367 aa  522  1e-147  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2528  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  60.92 
 
 
412 aa  522  1e-147  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.506084  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4295  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  68.55 
 
 
416 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.706948  normal  0.958774 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1177  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  68.55 
 
 
416 aa  511  1e-144  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.726447  normal  0.0669106 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3152  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  67.95 
 
 
416 aa  513  1e-144  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.284704 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1209  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  68.55 
 
 
415 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1191  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  68.55 
 
 
416 aa  511  1e-144  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.149701  normal  0.511312 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4238  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  68.55 
 
 
416 aa  511  1e-144  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49470  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  67.66 
 
 
415 aa  511  1e-144  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0051562  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4225  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  67.66 
 
 
415 aa  511  1e-144  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1661  ribonucleoside-diphosphate reductase, beta subunit  67.95 
 
 
415 aa  511  1e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3721  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  67.66 
 
 
415 aa  509  1e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33300  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  67.36 
 
 
416 aa  510  1e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2459  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  67.66 
 
 
423 aa  506  9.999999999999999e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.955756  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0667  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  66.77 
 
 
420 aa  501  1e-141  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0871304  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3002  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  63.9 
 
 
354 aa  492  9.999999999999999e-139  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.371001  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3664  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  57.8 
 
 
416 aa  490  1e-137  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2702  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  60.21 
 
 
369 aa  490  1e-137  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2887  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  58.73 
 
 
391 aa  487  1e-136  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.395919  normal  0.0685019 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4609  Ribonucleoside-diphosphate reductase  60.83 
 
 
360 aa  483  1e-135  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.384071 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2638  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  64.39 
 
 
373 aa  478  1e-134  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.66937  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3518  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  58.14 
 
 
386 aa  477  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0483754 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3158  Ribonucleoside-diphosphate reductase  62.61 
 
 
358 aa  474  1e-132  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.380157  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16400  ribonucleotide reductase, beta subunit  62.31 
 
 
349 aa  471  1e-132  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.876136  normal  0.394425 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1009  Ribonucleoside-diphosphate reductase  56.53 
 
 
398 aa  469  1.0000000000000001e-131  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.746585  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2103  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  61.29 
 
 
354 aa  456  1e-127  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.197754 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0430  Ribonucleoside-diphosphate reductase  61.06 
 
 
347 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0215  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  57.48 
 
 
346 aa  425  1e-118  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0959296  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2574  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  59.53 
 
 
342 aa  427  1e-118  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2622  Ribonucleoside-diphosphate reductase  58.41 
 
 
353 aa  419  1e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00719466  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2337  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  49.54 
 
 
330 aa  342  4e-93  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2656  Ribonucleoside-diphosphate reductase  48.18 
 
 
330 aa  332  5e-90  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.840275  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3460  amino acid adenylation  40.83 
 
 
368 aa  290  3e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00848931 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3856  ribonucleoside-diphosphate reductase  39.38 
 
 
352 aa  274  2.0000000000000002e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.468759  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1715  Ribonucleoside-diphosphate reductase  39.21 
 
 
364 aa  255  1.0000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.957793  normal  0.0111265 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1725  ribonucleoside-diphosphate reductase  36.73 
 
 
348 aa  213  4.9999999999999996e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21930  ribonucleotide reductase, beta subunit  36.11 
 
 
365 aa  208  1e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.113756  normal  0.84337 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4876  ribonucleoside-diphosphate reductase  35.19 
 
 
350 aa  206  5e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0340967 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2041  Ribonucleoside-diphosphate reductase  34.88 
 
 
331 aa  202  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.202371  normal  0.0413781 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4387  ribonucleoside-diphosphate reductase  34.26 
 
 
350 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.86185  normal  0.405922 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5565  Ribonucleoside-diphosphate reductase  33.24 
 
 
338 aa  195  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6268  Ribonucleoside-diphosphate reductase  34.26 
 
 
331 aa  192  9e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0689361 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0207  Ribonucleoside-diphosphate reductase  31.48 
 
 
339 aa  181  2e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0013  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  31.95 
 
 
340 aa  179  7e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0212  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  33.33 
 
 
329 aa  176  5e-43  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0119093  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0738  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  32.4 
 
 
338 aa  176  7e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00633879  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2355  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  32.34 
 
 
344 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0029  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  30.23 
 
 
340 aa  167  2.9999999999999998e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000949111  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1600  Ribonucleoside-diphosphate reductase  31.58 
 
 
369 aa  166  4e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0974461  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2093  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  30.56 
 
 
340 aa  167  4e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0297  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  30.86 
 
 
340 aa  166  5e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.382781  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2670  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  32.04 
 
 
344 aa  166  9e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0505  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  30.53 
 
 
319 aa  163  4.0000000000000004e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.350421 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>