More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2611 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_2611  amino acid adenylation  100 
 
 
614 aa  1246    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0335751  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0002  amino acid adenylation  43.13 
 
 
2867 aa  464  1e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0171576 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1968  amino acid adenylation domain-containing protein  43.6 
 
 
3639 aa  456  1e-127  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00734125 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1970  amino acid adenylation domain-containing protein  45.25 
 
 
1137 aa  458  1e-127  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0949143 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2461  linear gramicidin synthetase subunit C  41.83 
 
 
1518 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2413  amino acid adenylation domain-containing protein  41.45 
 
 
1569 aa  452  1.0000000000000001e-126  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2875  linear gramicidin synthetase subunit C  41.69 
 
 
1518 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5619  amino acid adenylation domain-containing protein  41.88 
 
 
1518 aa  445  1e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  40.7 
 
 
4968 aa  442  1e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1117  nonribosomal peptide synthetase DhbF  44.54 
 
 
1082 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0269  nonribosomal peptide synthetase DhbF  44.72 
 
 
1082 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0118  nonribosomal peptide synthetase DhbF  44.54 
 
 
1071 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0308  nonribosomal peptide synthetase DhbF  44.54 
 
 
1082 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1791  non-ribosomal peptide synthase  44.54 
 
 
1082 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1704  non-ribosomal peptide synthase  44.72 
 
 
1082 aa  442  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1287  nonribosomal peptide synthetase DhbF  44.54 
 
 
1082 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2859  peptide synthase  43.74 
 
 
4991 aa  438  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  43.93 
 
 
6889 aa  432  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3602  cyclic nucleotide-binding protein  44.52 
 
 
8211 aa  432  1e-120  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4753  amino acid adenylation domain-containing protein  44.08 
 
 
6176 aa  434  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.86552 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1758  amino acid adenylation domain-containing protein  39.97 
 
 
2386 aa  430  1e-119  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1859  amino acid adenylation domain-containing protein  42.47 
 
 
2596 aa  431  1e-119  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3743  amino acid adenylation domain protein  43.84 
 
 
2626 aa  430  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6901  amino acid adenylation domain protein  40.71 
 
 
2273 aa  430  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4754  amino acid adenylation domain-containing protein  43 
 
 
3331 aa  426  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1749  amino acid adenylation domain protein  41.83 
 
 
1199 aa  428  1e-118  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.82306  normal  0.0351239 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1677  amino acid adenylation domain protein  40.3 
 
 
3289 aa  426  1e-118  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  42.4 
 
 
13537 aa  423  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  40.56 
 
 
3291 aa  424  1e-117  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5940  amino acid adenylation domain-containing protein  43.94 
 
 
6999 aa  425  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33650  pyoverdine synthetase D  41.63 
 
 
2448 aa  424  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.769726  normal  0.0679691 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1674  amino acid adenylation domain-containing protein  42.17 
 
 
5230 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2148  pyoverdine sidechain peptide synthetase II, D-Asp-L-Thr component  41.57 
 
 
2625 aa  421  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.307821  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3541  amino acid adenylation domain-containing protein  42.66 
 
 
2137 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.432696  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1849  amino acid adenylation  41.61 
 
 
1383 aa  421  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3873  amino acid adenylation domain protein  41.74 
 
 
5698 aa  419  1e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.166545 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2988  nonribosomal peptide synthetase DhbF  38.91 
 
 
2385 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2390  nonribosomal peptide synthetase DhbF  38.91 
 
 
2385 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2830  non-ribosomal peptide synthetase SyfB  41.21 
 
 
5929 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2208  nonribosomal peptide synthetase DhbF  39.63 
 
 
2385 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2147  nonribosomal peptide synthetase  38.91 
 
 
2385 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.633458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2131  nonribosomal peptide synthetase  38.95 
 
 
2385 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2337  nonribosomal peptide synthetase DhbF  39.07 
 
 
2385 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2372  nonribosomal peptide synthetase DhbF  39.63 
 
 
2385 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1680  amino acid adenylation domain-containing protein  42.24 
 
 
1405 aa  419  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.616011  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6813  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase  42.01 
 
 
4383 aa  418  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2402  nonribosomal peptide synthetase DhbF  38.74 
 
 
2385 aa  412  1e-114  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.777196  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2149  pyoverdine sidechain peptide synthetase III, L-Thr-L-Ser component  40.81 
 
 
2151 aa  414  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1958  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  40.91 
 
 
2666 aa  415  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.815513 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2577  amino acid adenylation  42.53 
 
 
5926 aa  415  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2615  amino acid adenylation  42.13 
 
 
5469 aa  413  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.301045 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1886  amino acid adenylation domain protein  42.88 
 
 
3710 aa  412  1e-114  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2472  nonribosomal peptide synthetase DhbF  38.74 
 
 
2385 aa  413  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1959  amino acid adenylation  40.11 
 
 
2154 aa  410  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.992857 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2179  amino acid adenylation domain-containing protein  39.04 
 
 
2386 aa  410  1e-113  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1748  amino acid adenylation domain protein  41.33 
 
 
7712 aa  411  1e-113  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.970061 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1887  amino acid adenylation domain protein  42.5 
 
 
2614 aa  409  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2588  amino acid adenylation domain protein  43.3 
 
 
622 aa  405  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2614  amino acid adenylation  41.92 
 
 
5372 aa  405  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.797013 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18400  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  41.36 
 
 
5750 aa  403  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4083  amino acid adenylation domain-containing protein  40.67 
 
 
3942 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.223479 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  41.39 
 
 
8914 aa  402  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2212  non-ribosomal peptide synthase  39.29 
 
 
6081 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  39.4 
 
 
9498 aa  398  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0693  hypothetical protein  38.49 
 
 
6072 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3730  amino acid adenylation domain-containing protein  41.11 
 
 
2651 aa  393  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.390082 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2108  amino acid adenylation domain-containing protein  40.94 
 
 
2820 aa  389  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2459  amino acid adenylation  42.24 
 
 
4489 aa  389  1e-107  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.765153 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3577  amino acid adenylation domain protein  41.81 
 
 
2412 aa  386  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0694  hypothetical protein  38.47 
 
 
4572 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2450  amino acid adenylation  42.24 
 
 
4290 aa  389  1e-106  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2213  non-ribosomal peptide synthase  38.47 
 
 
4468 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3686  amino acid adenylation domain protein  42.64 
 
 
2395 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3740  amino acid adenylation domain protein  42.64 
 
 
2395 aa  379  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.209532 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2091  amino acid adenylation domain-containing protein  39.75 
 
 
1145 aa  376  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2786  amino acid adenylation domain-containing protein  41.72 
 
 
3208 aa  379  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0705629 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6558  non-ribosomal peptide synthase  42.17 
 
 
4106 aa  373  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138815 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1967  amino acid adenylation domain-containing protein  38.05 
 
 
1087 aa  375  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0381021 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2570  amino acid adenylation domain-containing protein  35.98 
 
 
3114 aa  375  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0117255 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2095  amino acid adenylation domain-containing protein  38.46 
 
 
3395 aa  370  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.800691  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3733  amino acid adenylation  39.43 
 
 
2378 aa  364  2e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5189  amino acid adenylation domain protein  36.7 
 
 
6202 aa  359  9.999999999999999e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000018726 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3681  amino acid adenylation domain protein  38.45 
 
 
1142 aa  354  2.9999999999999997e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3733  amino acid adenylation domain protein  37.63 
 
 
11233 aa  351  2e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6557  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  37.12 
 
 
2320 aa  340  5.9999999999999996e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000475071 
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  38.88 
 
 
5953 aa  337  5e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2131  hypothetical protein  32.66 
 
 
1439 aa  335  1e-90  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1610  amino acid adenylation  35.85 
 
 
1142 aa  335  2e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0752074 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3693  amino acid adenylation domain protein  38.15 
 
 
2274 aa  332  1e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18410  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  37.63 
 
 
7310 aa  332  2e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2874  non-ribosomal peptide synthase  33.33 
 
 
2156 aa  330  4e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5752  amino acid adenylation domain protein  34.4 
 
 
1069 aa  329  9e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  37.73 
 
 
6403 aa  328  2.0000000000000001e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  38.53 
 
 
8646 aa  327  5e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3091  amino acid adenylation domain protein  33.11 
 
 
1870 aa  325  2e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2462  linear gramicidin synthetase subunit D  33.05 
 
 
2156 aa  324  3e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3546  amino acid adenylation domain-containing protein  37.25 
 
 
3404 aa  324  3e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5872  amino acid adenylation domain protein  35.05 
 
 
1550 aa  323  5e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00539466 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3030  amino acid adenylation domain protein  33.05 
 
 
1870 aa  322  9.000000000000001e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2463  bacitracin synthetase 1  36.02 
 
 
4960 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>