22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1620 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3865  hypothetical protein  88.69 
 
 		 398 aa  748    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.999918  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1620  hypothetical protein  100 
 
 		 398 aa  828    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.376452 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3455  aminotransferase class I and II  30.16 
 
 		 377 aa  160  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.36612  hitchhiker  0.000000549175 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2431  hypothetical protein  29.32 
 
 		 305 aa  123  5e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000928736  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0111  putative aspartate transaminase  24.48 
 
 		 401 aa  52.8  0.00001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2636  aminotransferase class I and II  22.56 
 
 		 384 aa  50.4  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2582  aminotransferase, class I and II  22.56 
 
 		 384 aa  50.4  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6328  aminotransferase class I and II  24.57 
 
 		 397 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.657142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1684  aspartate aminotransferase  22.91 
 
 		 396 aa  48.1  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.121725  normal  0.0684909 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2134  aminotransferase, class I  20.11 
 
 		 386 aa  47.8  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3600  aspartate aminotransferase  21.84 
 
 		 391 aa  46.6  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.954111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4019  aspartate aminotransferase  21.74 
 
 		 400 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.199022 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0243  aminotransferase class I and II  22.12 
 
 		 393 aa  46.2  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1287  aminotransferase class I and II  35.38 
 
 		 356 aa  44.3  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0948768  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0487  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  40.74 
 
 		 399 aa  44.3  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2218  aminotransferase class I and II  23.68 
 
 		 382 aa  44.3  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.156784  normal  0.455276 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2262  aminotransferase class I and II  22.32 
 
 		 393 aa  43.5  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.222348  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0388  aminotransferase class I and II  23.36 
 
 		 392 aa  43.5  0.007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0017  aspartate aminotransferase  22.67 
 
 		 403 aa  43.5  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3357  class I/II aminotransferase  21.33 
 
 		 402 aa  43.5  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.676088  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00370  aminotransferase  22.93 
 
 		 390 aa  43.1  0.008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.394696 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1128  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  19.41 
 
 		 394 aa  42.7  0.01  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>