44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0733 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_0733  relaxase  100 
 
 		 318 aa  650    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1422  hypothetical protein  97.66 
 
 		 634 aa  595  1e-169  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.114874  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0831  hypothetical protein  90.97 
 
 		 642 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4529  relaxase  68.33 
 
 		 643 aa  401  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60130  hypothetical protein  68.33 
 
 		 639 aa  402  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829078  hitchhiker  0.00000000146114 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4433  relaxase  68.67 
 
 		 639 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36580  Relaxase-related protein  67.56 
 
 		 631 aa  392  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0425  Relaxase  59.6 
 
 		 599 aa  378  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0932  Relaxase  59.8 
 
 		 616 aa  364  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2405  hypothetical protein  59.8 
 
 		 612 aa  367  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2175  relaxase  59.8 
 
 		 614 aa  365  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2872  Relaxase  60 
 
 		 615 aa  362  4e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0649581  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1245  relaxase  59.8 
 
 		 627 aa  360  2e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1173  hypothetical protein  60.46 
 
 		 615 aa  358  6e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1614  Relaxase  58.75 
 
 		 593 aa  352  4e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4190  relaxase  59.15 
 
 		 617 aa  352  7e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136156  normal  0.342151 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3435  relaxase  60.13 
 
 		 621 aa  351  1e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428865 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0694  Relaxase  58.63 
 
 		 615 aa  348  9e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3034  hypothetical protein  56.62 
 
 		 575 aa  347  1e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.877854  normal  0.900283 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2364  relaxase  59.15 
 
 		 680 aa  347  1e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000606357  hitchhiker  0.000030776 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3339  relaxase  58.19 
 
 		 569 aa  340  1e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1387  relaxase  58.5 
 
 		 660 aa  330  2e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2962  relaxase  57.58 
 
 		 595 aa  319  3e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.290207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0568  relaxase  56.76 
 
 		 623 aa  301  1e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1792  hypothetical protein  47.04 
 
 		 640 aa  279  5e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3950  relaxase  34.28 
 
 		 624 aa  142  9e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0583286  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4049  relaxase  34.69 
 
 		 560 aa  125  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.758954 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4118  relaxase  33.16 
 
 		 569 aa  122  7e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0400  relaxase  33.33 
 
 		 570 aa  122  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.361957  normal  0.0772849 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0709  protein of unknown function DUF1528  29.91 
 
 		 485 aa  118  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3687  putative helicase  31.13 
 
 		 398 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3357  helicase/Zfx/Zfy transcription activation region domain-containing protein  30.27 
 
 		 551 aa  102  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0065  type IV conjugative transfer system protein TraI  28.9 
 
 		 990 aa  95.9  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2772  metal dependent phosphohydrolase  28.07 
 
 		 861 aa  94.4  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.219356  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3051  protein of unknown function DUF1528  29.02 
 
 		 478 aa  84.3  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2814  Relaxase  27.91 
 
 		 1096 aa  74.7  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.127016  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2854  hypothetical protein  22.13 
 
 		 445 aa  64.3  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2994  hypothetical protein  22.95 
 
 		 445 aa  63.5  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1550  FHA domain-containing protein  26.09 
 
 		 597 aa  58.5  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.230045  normal  0.0300322 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4265  relaxase  28.57 
 
 		 941 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0350547  normal  0.8702 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5472  hypothetical protein  24.26 
 
 		 611 aa  58.2  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0952115 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4740  Relaxase  23.44 
 
 		 721 aa  52.4  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.428204 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2597  relaxase  23.57 
 
 		 549 aa  45.4  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.856889 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2306  relaxase  22.96 
 
 		 571 aa  45.8  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.201735  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>