16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0166 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_0166  hypothetical protein  100 
 
 		 436 aa  908    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.539616 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6097  hypothetical protein  40.96 
 
 		 427 aa  334  1e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.901911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4053  hypothetical protein  41.16 
 
 		 407 aa  316  4e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.838771  normal  0.549592 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1775  hypothetical protein  25.05 
 
 		 396 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.062181 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1608  hypothetical protein  30.46 
 
 		 150 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1107  hypothetical protein  23.51 
 
 		 318 aa  80.5  0.00000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0283208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0990  hypothetical protein  24.65 
 
 		 293 aa  74.7  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.677101  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5645  hypothetical protein  25.15 
 
 		 312 aa  73.2  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2561  hypothetical protein  25.51 
 
 		 296 aa  70.5  0.00000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3853  hypothetical protein  24.13 
 
 		 302 aa  69.7  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4707  hypothetical protein  24.93 
 
 		 289 aa  66.6  0.0000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1603  hypothetical protein  29.14 
 
 		 262 aa  54.3  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0478  hypothetical protein  21.09 
 
 		 308 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00102471  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3187  hypothetical protein  30.43 
 
 		 161 aa  46.6  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3190  hypothetical protein  26.16 
 
 		 146 aa  46.2  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4335  hypothetical protein  27.13 
 
 		 140 aa  43.9  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.525857  normal  0.453219 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>