31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0478 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0478  phage TraR/DksA family protein  100 
 
 		 66 aa  138  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.1711  normal  0.241622 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5061  hypothetical protein  45.07 
 
 		 69 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0899139  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0695  hypothetical protein  45.07 
 
 		 69 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0756  hypothetical protein  45.45 
 
 		 66 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0374591  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1685  transcriptional regulator, TraR/DksA family  34.78 
 
 		 69 aa  47.8  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.554769  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3037  C4-type zinc finger DksA/TraR family protein  43.28 
 
 		 72 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0965532  normal  0.257312 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1494  transcriptional regulator, TraR/DksA family  34.78 
 
 		 69 aa  47  0.00008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1292  TraR/DksA family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 67 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1738  hypothetical protein  38.03 
 
 		 88 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00500709  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05034  DnaK suppressor protein  43.48 
 
 		 72 aa  44.3  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07970  hypothetical protein  40.91 
 
 		 66 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  2.71217e-16  hitchhiker  0.000634076 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1167  hypothetical protein  42.86 
 
 		 87 aa  43.9  0.0008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1862  hypothetical protein  40 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00332482  normal  0.539982 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0730  TraR/DksA family transcriptional regulator  40 
 
 		 68 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00565405  normal  0.112196 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2085  transcriptional regulator, TraR/DksA family  38.24 
 
 		 68 aa  42.7  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2704  hypothetical protein  43.33 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.422967  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0176  hypothetical protein  43.33 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00392065  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2549  hypothetical protein  41.38 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0858  hypothetical protein  41.38 
 
 		 88 aa  42  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00787  hypothetical protein  41.38 
 
 		 88 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0952  hypothetical protein  41.38 
 
 		 88 aa  42  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0827  hypothetical protein  41.38 
 
 		 88 aa  42  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.841992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2840  hypothetical protein  41.38 
 
 		 88 aa  42  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.940906  normal  0.101671 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0871  hypothetical protein  41.38 
 
 		 88 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00770  hypothetical protein  41.38 
 
 		 88 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3419  C4-type zinc finger protein, DksA/TraR family  44.29 
 
 		 75 aa  41.6  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00386497  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2839  transcriptional regulator, TraR/DksA family  41.38 
 
 		 88 aa  42  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1480  hypothetical protein  38.98 
 
 		 88 aa  41.6  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1233  hypothetical protein  41.38 
 
 		 88 aa  41.6  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2541  hypothetical protein  46.43 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2947  hypothetical protein  40.35 
 
 		 88 aa  40.4  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.223747 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>