106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0277 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_0277  hypothetical protein  100 
 
 
323 aa  672    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0304  hypothetical protein  91.08 
 
 
314 aa  606  9.999999999999999e-173  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2203  metallophosphoesterase  58.77 
 
 
329 aa  388  1e-107  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4095  metallophosphoesterase  37.1 
 
 
309 aa  218  1e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1311  metallophosphoesterase  38.41 
 
 
311 aa  216  5.9999999999999996e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.452113  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2943  metallophosphoesterase  36.66 
 
 
324 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0111879  normal  0.777233 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5182  metallophosphoesterase  37.69 
 
 
352 aa  181  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1103  metallophosphoesterase  37.46 
 
 
350 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2270  hypothetical protein  35.15 
 
 
454 aa  170  3e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2196  metallophosphoesterase  36.18 
 
 
323 aa  169  7e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1831  hypothetical protein  35.37 
 
 
427 aa  167  1e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.191572 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24230  hypothetical protein  34.32 
 
 
326 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000134322  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2071  diadenosine tetraphosphatase and related serine/threonine protein phosphatase  35.39 
 
 
337 aa  162  7e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.125008  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2051  hypothetical protein  33.99 
 
 
326 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00546921  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1308  hypothetical protein  32.81 
 
 
335 aa  160  3e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1734  serine/threonine protein phosphatase  34.89 
 
 
338 aa  157  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1573  metallophosphoesterase  34.3 
 
 
323 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.24274 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1910  hypothetical protein  33.56 
 
 
298 aa  157  3e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0184163  decreased coverage  0.000813491 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34060  Metallophosphoesterase protein  34.97 
 
 
328 aa  156  4e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0103996  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3792  serine/threonine protein phosphatase  33.77 
 
 
323 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.055034  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1686  metallophosphoesterase  33.44 
 
 
321 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.275545  normal  0.859247 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1545  metallophosphoesterase  31.68 
 
 
323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.556937  normal  0.552799 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2013  metallophosphoesterase  31.68 
 
 
323 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3729  metallophosphoesterase  31.68 
 
 
323 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2477  ADP-ribosylation/crystallin J1  29.83 
 
 
1138 aa  137  3.0000000000000003e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.462272 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2707  metallophosphoesterase  26.26 
 
 
412 aa  97.1  4e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.144061 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1977  metallophosphoesterase  49.4 
 
 
850 aa  76.3  0.0000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.350042  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1593  metallophosphoesterase  43.18 
 
 
858 aa  73.2  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.97058  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3744  putative protein serine-threonine phosphatase  41.18 
 
 
852 aa  69.7  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.614096  normal  0.060115 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1195  metallophosphoesterase  35.04 
 
 
863 aa  67.8  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0827204  normal  0.0150565 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4972  metallophosphoesterase  32.9 
 
 
360 aa  67.8  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0483  metallophosphoesterase  45.33 
 
 
830 aa  66.6  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0778  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase PrpE  40.79 
 
 
245 aa  66.2  0.0000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2768  metallophosphoesterase  33.33 
 
 
870 aa  65.1  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4542  metallophosphoesterase  39.33 
 
 
859 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.703829 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3131  metallophosphoesterase  43.37 
 
 
857 aa  63.5  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000324494  hitchhiker  0.000110445 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2565  metallophosphoesterase  43.04 
 
 
261 aa  62.4  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.887956  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1664  metallophosphoesterase  43.24 
 
 
269 aa  62.4  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0848196 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0167  metallophosphoesterase  43.37 
 
 
852 aa  61.2  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.500527 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2983  metallophosphoesterase  41.46 
 
 
854 aa  60.8  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1654  serine/threonine specific protein phosphatase  32.87 
 
 
206 aa  59.7  0.00000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.0069459  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2179  metallophosphoesterase  36.99 
 
 
258 aa  59.3  0.00000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6752  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase(symmetrical)  40.26 
 
 
847 aa  58.9  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1723  Bis(5'-nucleosyl)- tetraphosphatase(asymmetrical)  38.1 
 
 
853 aa  58.5  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000078095  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1633  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase PrpE  38.16 
 
 
245 aa  57.8  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0921  metallophosphoesterase  37.04 
 
 
847 aa  57  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.168883  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5514  metallophosphoesterase  39.51 
 
 
870 aa  57  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.425865  normal  0.108613 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37630  predicted kinase  40.74 
 
 
877 aa  56.6  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0942  Bis(5'-nucleosyl)- tetraphosphatase(asymmetrical)  39.02 
 
 
852 aa  55.5  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1324  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase PrpE  37.66 
 
 
246 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3285  Bis(5'-nucleosyl)- tetraphosphatase(asymmetrical)  37.35 
 
 
847 aa  53.5  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00153744 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07700  diadenosine tetraphosphatase  32.08 
 
 
283 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0256257 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2592  putative phosphatase  38.75 
 
 
447 aa  51.2  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.739631  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1658  diadenosine tetraphosphatase  35.9 
 
 
282 aa  50.8  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0734  diadenosine tetraphosphatase  32.08 
 
 
283 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09581  Serine/threonine specific protein phosphatase  28.28 
 
 
342 aa  50.4  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.392097 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1124  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase PrpE  36.36 
 
 
246 aa  49.7  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1099  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase PrpE  36.36 
 
 
246 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1680  serine/threonine protein phosphatase  35.23 
 
 
235 aa  49.7  0.00007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1217  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase PrpE  36.36 
 
 
246 aa  49.7  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1286  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase PrpE  36.36 
 
 
246 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1362  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase PrpE  36.36 
 
 
246 aa  49.3  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3502  metallophosphoesterase  43.21 
 
 
834 aa  49.3  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1105  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase PrpE  35.06 
 
 
246 aa  48.9  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1216  metallophosphoesterase  30.39 
 
 
291 aa  48.1  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.498854 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4396  metallophosphoesterase  37.5 
 
 
245 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0441457 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0625  diadenosine tetraphosphatase  27.41 
 
 
282 aa  47.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5137  diadenosine tetraphosphatase  31.4 
 
 
293 aa  47  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00806  diadenosine tetraphosphatase  26.62 
 
 
268 aa  47  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4084  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase PrpE  33.77 
 
 
246 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1281  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  33.68 
 
 
287 aa  47  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1112  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase PrpE  35.06 
 
 
246 aa  46.6  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1257  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase PrpE  35.06 
 
 
246 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0962  diadenosine tetraphosphatase  30.28 
 
 
280 aa  46.2  0.0008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0159  diadenosine tetraphosphatase  34.88 
 
 
278 aa  45.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1049  diadenosine tetraphosphatase  32.14 
 
 
275 aa  45.8  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0099941  normal  0.793665 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0052  metallophosphoesterase  33.73 
 
 
267 aa  45.4  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0681  diadenosine tetraphosphatase  32.93 
 
 
283 aa  44.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2707  metallophosphoesterase  33.73 
 
 
242 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430014  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0223  diadenosine tetraphosphatase  34.15 
 
 
279 aa  44.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2701  metallophosphoesterase  31.33 
 
 
246 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.41286  normal  0.371482 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0262  diadenosine tetraphosphatase  28.4 
 
 
279 aa  45.1  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2800  metallophosphoesterase  33.33 
 
 
242 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0227115  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0573  diadenosine tetraphosphatase  34.15 
 
 
296 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2392  metallophosphoesterase  37.36 
 
 
852 aa  45.1  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.949066  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3932  diadenosine tetraphosphatase  31.63 
 
 
276 aa  44.3  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1047  metallophosphoesterase  29.32 
 
 
293 aa  44.3  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0240  diadenosine tetraphosphatase  27.16 
 
 
279 aa  44.3  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.589484  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0918  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase PrpE  32.47 
 
 
246 aa  44.3  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.562168  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1296  metallophosphoesterase  30.34 
 
 
230 aa  44.3  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1187  metallophosphoesterase  27.16 
 
 
243 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634228  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2893  metallophosphoesterase  33.33 
 
 
242 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.331732  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1582  metallophosphoesterase  38.75 
 
 
265 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000731771  normal  0.190685 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0558  serine/threonine protein phosphatase 1  29.69 
 
 
244 aa  43.5  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.296143  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0711  diadenosine tetraphosphatase  37.04 
 
 
277 aa  43.5  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1455  diadenosine tetraphosphatase  29.36 
 
 
280 aa  43.5  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0598  diadenosine tetraphosphatase  33.33 
 
 
282 aa  43.5  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.158681  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2859  diadenosine tetraphosphatase  35 
 
 
269 aa  43.5  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000394159  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1327  Ser/Thr protein phosphatase family protein  29.5 
 
 
240 aa  43.1  0.006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4015  diadenosine tetraphosphatase  26.05 
 
 
272 aa  42.7  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>