More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1446 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1446  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
465 aa  959    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.112354  normal  0.248948 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1858  aldehyde dehydrogenase  70.59 
 
 
459 aa  702    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0838083 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10478  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  59.25 
 
 
473 aa  574  1.0000000000000001e-162  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.128776  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03968  succinate-semialdehyde dehydrogenase  52.83 
 
 
462 aa  516  1.0000000000000001e-145  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1911  aldehyde dehydrogenase  50.88 
 
 
458 aa  497  1e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2008  Aldehyde Dehydrogenase  44.52 
 
 
465 aa  428  1e-118  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1292  succinate-semialdehyde dehydrogenase [NADP+]  44.96 
 
 
458 aa  423  1e-117  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6328  Aldehyde Dehydrogenase  42.76 
 
 
460 aa  420  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0373532  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2399  Aldehyde Dehydrogenase  42.64 
 
 
460 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0330  aldehyde dehydrogenase family protein  40.22 
 
 
457 aa  400  9.999999999999999e-111  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0316513  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2321  Aldehyde Dehydrogenase  41.89 
 
 
466 aa  398  9.999999999999999e-111  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1074  putative aldehyde dehydrogenase  41.45 
 
 
454 aa  390  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000640606  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1159  Aldehyde Dehydrogenase  40.87 
 
 
466 aa  388  1e-106  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2100  Aldehyde Dehydrogenase  40.26 
 
 
457 aa  385  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.773732  normal  0.123203 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2070  aldehyde dehydrogenase  41.92 
 
 
475 aa  387  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0905776  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0388  Aldehyde Dehydrogenase_  41.3 
 
 
458 aa  383  1e-105  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000227501  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2400  Aldehyde Dehydrogenase  44.32 
 
 
463 aa  379  1e-104  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2056  Aldehyde Dehydrogenase  39.78 
 
 
457 aa  379  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0119311 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1926  aldehyde dehydrogenase  41.23 
 
 
455 aa  379  1e-104  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.515635  normal  0.086374 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2448  aldehyde dehydrogenase  40.97 
 
 
452 aa  373  1e-102  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0352  aldehyde dehydrogenase family protein  39.13 
 
 
457 aa  370  1e-101  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000509141  normal  0.584654 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1858  Aldehyde Dehydrogenase  39.57 
 
 
457 aa  371  1e-101  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1346  Aldehyde Dehydrogenase  40.17 
 
 
454 aa  369  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.211595  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3175  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  39.91 
 
 
465 aa  367  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.909574  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0839  aldehyde Dehydrogenase  40.35 
 
 
455 aa  364  1e-99  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0391  aldehyde dehydrogenase  39.43 
 
 
454 aa  365  1e-99  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.641534  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1989  aldehyde dehydrogenase family protein  39.87 
 
 
462 aa  363  3e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00344108  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2737  Aldehyde Dehydrogenase  42.11 
 
 
454 aa  362  8e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1725  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.26 
 
 
471 aa  361  2e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.450617  decreased coverage  0.000946553 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3003  aldehyde dehydrogenase  39.57 
 
 
469 aa  359  5e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000280927  normal  0.841466 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3534  aldehyde dehydrogenase  40.96 
 
 
455 aa  359  6e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.46589 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4209  Aldehyde Dehydrogenase  40.57 
 
 
455 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4169  Aldehyde Dehydrogenase  40.57 
 
 
455 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0377  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  40.57 
 
 
454 aa  357  2.9999999999999997e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1742  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.26 
 
 
470 aa  357  2.9999999999999997e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.847315  normal  0.737233 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0984  aldehyde dehydrogenase  38.95 
 
 
463 aa  355  1e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1006  Aldehyde Dehydrogenase  38.73 
 
 
463 aa  354  2e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1018  aldehyde dehydrogenase  38.73 
 
 
463 aa  354  2e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.752265  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0333  Aldehyde Dehydrogenase  39.04 
 
 
452 aa  354  2e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.909996  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6093  NAD-dependent succinate aldehyde dehydrogenase  40.7 
 
 
463 aa  354  2e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.336343  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1626  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  39.51 
 
 
463 aa  353  2.9999999999999997e-96  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.411023  normal  0.0128015 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00454  aldehyde-dehydrogenase like protein YneI  39.69 
 
 
454 aa  353  5e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0760178  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9222  NAD-dependent succinate aldehyde dehydrogenase  41.14 
 
 
463 aa  353  5e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3039  putative succinate-semialdehyde dehydrogenase  40.7 
 
 
477 aa  351  2e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2711  Aldehyde Dehydrogenase  37.66 
 
 
464 aa  351  2e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.275428  hitchhiker  0.000000324245 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1299  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  38.39 
 
 
470 aa  351  2e-95  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00410405  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1706  Aldehyde Dehydrogenase  40.92 
 
 
463 aa  350  4e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.588412 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3357  aldehyde dehydrogenase  38.29 
 
 
463 aa  349  6e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4057  Aldehyde Dehydrogenase  39.52 
 
 
457 aa  349  7e-95  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0175  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  37.69 
 
 
455 aa  349  7e-95  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2946  aldehyde dehydrogenase  38.07 
 
 
463 aa  348  1e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2488  succinic-semialdehyde dehydrogenase, putative  40.04 
 
 
463 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.101295  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4408  Aldehyde Dehydrogenase  39.35 
 
 
457 aa  344  2e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0775  aldehyde dehydrogenase  38.65 
 
 
463 aa  343  2.9999999999999997e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.442992  normal  0.410628 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0508  aldehyde dehydrogenase  40.8 
 
 
456 aa  343  4e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.143875 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1090  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  39.29 
 
 
468 aa  343  4e-93  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.033581  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1223  Aldehyde Dehydrogenase  40.13 
 
 
462 aa  342  5.999999999999999e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1825  Aldehyde Dehydrogenase  38 
 
 
461 aa  342  9e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.450038 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2363  putative aldehyde dehydrogenase  38.44 
 
 
460 aa  341  1e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.97252  normal  0.760818 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1124  aldehyde dehydrogenase family protein  37.86 
 
 
458 aa  340  2e-92  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.115238  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1541  hypothetical protein  36.76 
 
 
462 aa  340  2.9999999999999998e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1442  hypothetical protein  36.76 
 
 
462 aa  339  5.9999999999999996e-92  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0523  putative aldehyde dehydrogenase  38.18 
 
 
460 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09770  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  39.14 
 
 
461 aa  338  9e-92  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00172669  normal  0.0203425 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0034  aldehyde dehydrogenase  38.19 
 
 
457 aa  338  9.999999999999999e-92  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000822234  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1811  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  36.73 
 
 
462 aa  337  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2911  Aldehyde Dehydrogenase  39.39 
 
 
458 aa  337  1.9999999999999998e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0462  aldehyde dehydrogenase  37.67 
 
 
526 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.433916  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1637  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  36.73 
 
 
462 aa  337  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1696  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  36.73 
 
 
462 aa  337  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.087576  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1646  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  36.5 
 
 
462 aa  337  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00984812  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1956  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.9 
 
 
457 aa  337  2.9999999999999997e-91  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1629  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  36.73 
 
 
462 aa  336  3.9999999999999995e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0488  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  39.43 
 
 
468 aa  337  3.9999999999999995e-91  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.627083  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3025  aldehyde dehydrogenase  37.2 
 
 
469 aa  335  1e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4244  aldehyde dehydrogenase  40.09 
 
 
452 aa  334  2e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0803768  normal  0.0353537 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2453  Aldehyde Dehydrogenase  37.69 
 
 
455 aa  333  4e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1887  aldehyde dehydrogenase  37.12 
 
 
456 aa  332  6e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0914  aldehyde dehydrogenase  39.69 
 
 
457 aa  332  6e-90  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.929249 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0352  aldehyde dehydrogenase  35.31 
 
 
459 aa  332  8e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.491139  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0160  aldehyde dehydrogenase  40 
 
 
456 aa  330  3e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3617  Aldehyde Dehydrogenase  34.27 
 
 
470 aa  330  3e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3122  Aldehyde Dehydrogenase_  36.76 
 
 
469 aa  330  3e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0781135  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4244  aldehyde dehydrogenase  37.28 
 
 
452 aa  330  3e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1971  aldehyde dehydrogenase  38.26 
 
 
460 aa  329  7e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3223  Aldehyde Dehydrogenase  36.54 
 
 
469 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.989475  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0821  aldehyde dehydrogenase  37.99 
 
 
457 aa  328  1.0000000000000001e-88  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.376923  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1120  aldehyde dehydrogenase  37.42 
 
 
485 aa  328  1.0000000000000001e-88  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000801479 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2216  Aldehyde Dehydrogenase  36.68 
 
 
474 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.273207  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4853  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  40.88 
 
 
456 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1620  aldehyde dehydrogenase  38.16 
 
 
454 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2032  aldehyde dehydrogenase  39.56 
 
 
460 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.187325  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2660  aldehyde dehydrogenase family protein  36.06 
 
 
463 aa  327  3e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.349181  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2394  aldehyde dehydrogenase  36.73 
 
 
463 aa  327  3e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0666523  normal  0.869122 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2005  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  37.61 
 
 
462 aa  327  3e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.176912 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4876  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  40.88 
 
 
456 aa  327  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.570732 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2894  aldehyde dehydrogenase  35.08 
 
 
461 aa  326  5e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.237665  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4194  Aldehyde Dehydrogenase  36.62 
 
 
487 aa  326  5e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4778  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  40.66 
 
 
456 aa  325  9e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4926  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  40.66 
 
 
456 aa  325  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.813756 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>