23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_4354 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_4354  hypothetical protein  100 
 
 		 254 aa  518  1e-146  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00552535  normal  0.0179088 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1369  hypothetical protein  96.3 
 
 		 243 aa  482  1e-135  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.271158 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4445  hypothetical protein  89.76 
 
 		 254 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00317047  hitchhiker  0.000033336 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1009  putative deacetylase  76.19 
 
 		 254 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00774779  hitchhiker  0.00000000000895825 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4433  hypothetical protein  67.77 
 
 		 258 aa  340  1e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.323025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56040  hypothetical protein  68.02 
 
 		 253 aa  338  7e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4879  hypothetical protein  67.74 
 
 		 253 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222084  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17920  hypothetical protein  63.97 
 
 		 255 aa  310  1e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00986232  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1223  hypothetical protein  61.85 
 
 		 258 aa  299  3e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3884  hypothetical protein  42.39 
 
 		 264 aa  182  3e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3772  hypothetical protein  42.39 
 
 		 264 aa  182  3e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.516985  normal  0.0626785 
 
 
-
 
NC_003296  RS02231  hypothetical protein  42.8 
 
 		 261 aa  177  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3284  putative deacetylase  30.2 
 
 		 250 aa  88.2  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0696  deacetylase-like protein  26.87 
 
 		 244 aa  84  0.000000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1811  polysaccharide deacetylase  32.56 
 
 		 249 aa  79.3  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1140  deacetylase-like protein  23.45 
 
 		 229 aa  69.3  0.00000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10799  hypothetical protein  33.58 
 
 		 228 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5133  hypothetical protein  30.25 
 
 		 236 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4644  hypothetical protein  31.47 
 
 		 234 aa  52  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4556  hypothetical protein  31.47 
 
 		 234 aa  52  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4939  hypothetical protein  31.47 
 
 		 234 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.250268 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1620  hypothetical protein  33.33 
 
 		 234 aa  43.9  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3616  hypothetical protein  27.92 
 
 		 232 aa  43.5  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.689056  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>