271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_1565 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009512  Pput_1565  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  100 
 
 
332 aa  683    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105023  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4305  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  98.8 
 
 
332 aa  675    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3870  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  97.59 
 
 
332 aa  639    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3632  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  96.69 
 
 
332 aa  632  1e-180  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1591  thiosulphate-binding protein  90.36 
 
 
332 aa  627  1e-179  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00740648  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3383  extracellular solute-binding protein  87.06 
 
 
341 aa  565  1e-160  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0659293  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3625  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  86.73 
 
 
332 aa  542  1e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.929699  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45110  sulfate-binding protein of ABC transporter  83.64 
 
 
332 aa  542  1e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3839  sulfate-binding protein of ABC transporter  83.03 
 
 
332 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30540  Sulfate ABC transporter-binding component-CysP-like protein  79.52 
 
 
332 aa  536  1e-151  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0614  thiosulphate-binding protein  57.53 
 
 
329 aa  402  1e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.772188 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0123  thiosulfate binding protein  58.7 
 
 
337 aa  394  1e-109  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000442607 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3894  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  57.58 
 
 
337 aa  386  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0402445  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1906  thiosulphate-binding protein  59.15 
 
 
337 aa  386  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000896115  hitchhiker  0.00000000124986 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1723  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  60.45 
 
 
329 aa  386  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000440935  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1346  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  59.61 
 
 
337 aa  382  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3693  thiosulphate-binding protein  56.72 
 
 
332 aa  379  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0443  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  54.82 
 
 
341 aa  376  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4267  sulfate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  54.82 
 
 
341 aa  376  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2134  thiosulphate-binding protein  56.27 
 
 
331 aa  374  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.73195e-21  decreased coverage  0.000103932 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03700  sulfate-binding protein precursor  56.91 
 
 
332 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000120397 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0169  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  55.79 
 
 
341 aa  374  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0821  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  55.73 
 
 
329 aa  368  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0561556  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0291  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  53.61 
 
 
335 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.483831 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3804  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  56.31 
 
 
337 aa  369  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0374  sulfate-binding protein precursor  55.91 
 
 
332 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.93068  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0899  sulfate starvation-induced protein 2  55.23 
 
 
338 aa  367  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.368441  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1274  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  55.08 
 
 
339 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.401936  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0084  extracellular solute-binding protein  54.05 
 
 
336 aa  365  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5231  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  53.92 
 
 
335 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.297946  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0507  thiosulphate-binding protein  52.89 
 
 
330 aa  365  1e-100  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.347365  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3560  thiosulphate-binding protein  53.47 
 
 
329 aa  367  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1211  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  55.08 
 
 
339 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0110956  normal  0.0538246 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31720  Sulfate-binding precursor protein  55.99 
 
 
332 aa  366  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1045  thiosulphate-binding protein  53.87 
 
 
327 aa  363  2e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4010  thiosulphate-binding protein  53.58 
 
 
329 aa  363  2e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.311837 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0194  thiosulphate-binding protein  53.15 
 
 
337 aa  363  3e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.648325  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5171  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  53.61 
 
 
342 aa  362  4e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138843  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6977  sulfate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  53.56 
 
 
329 aa  362  5.0000000000000005e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5078  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  53.31 
 
 
335 aa  362  6e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.151813  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4345  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  55.41 
 
 
332 aa  361  8e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1336  sulfate-binding precursor signal peptide protein  55.63 
 
 
336 aa  360  1e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.533362  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4641  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  54.82 
 
 
340 aa  358  8e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.869357  hitchhiker  0.00000640821 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0733  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  49.7 
 
 
337 aa  358  9e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2531  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  51.52 
 
 
356 aa  358  9e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000783626  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2422  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  53.56 
 
 
343 aa  358  9.999999999999999e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.944907 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0308  sulfate-binding protein  52.84 
 
 
338 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0628  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  54.72 
 
 
335 aa  356  2.9999999999999997e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1156  thiosulphate-binding protein  53.56 
 
 
329 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.464796 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4461  sulfate transporter subunit  55.59 
 
 
329 aa  355  5e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2470  ABC sulfate/thiosulfate transporter, periplasmic ligand binding protein, CysP  55.99 
 
 
346 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0297151  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0325  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  54.87 
 
 
337 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4280  sulfate transporter subunit  55.59 
 
 
329 aa  355  7.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0399629  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4652  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  49.7 
 
 
337 aa  354  1e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4394  sulfate transporter subunit  55.26 
 
 
329 aa  354  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.770755  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0620  thiosulphate-binding protein  54.8 
 
 
336 aa  354  1e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000295034  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3094  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  53.25 
 
 
336 aa  354  1e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1552  thiosulphate-binding protein  52.15 
 
 
335 aa  353  2e-96  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4392  sulfate transporter subunit  55.26 
 
 
329 aa  353  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.188872  normal  0.694674 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4309  sulfate transporter subunit  55.26 
 
 
329 aa  352  4e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5372  sulfate transporter subunit  54.61 
 
 
329 aa  352  4e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03802  sulfate transporter subunit  54.61 
 
 
329 aa  352  5.9999999999999994e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4068  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  54.61 
 
 
329 aa  352  5.9999999999999994e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3315  hypothetical protein  54.93 
 
 
328 aa  352  5.9999999999999994e-96  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.227914  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4101  sulfate transporter subunit  54.61 
 
 
329 aa  352  5.9999999999999994e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4357  sulfate transporter subunit  54.61 
 
 
329 aa  352  5.9999999999999994e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.427406 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03751  hypothetical protein  54.61 
 
 
329 aa  352  5.9999999999999994e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4451  sulfate transporter subunit  54.61 
 
 
329 aa  352  5.9999999999999994e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4148  sulfate transporter subunit  54.61 
 
 
329 aa  352  5.9999999999999994e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2061  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  51.39 
 
 
331 aa  351  8e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.647625  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1978  thiosulphate-binding protein  57.79 
 
 
335 aa  351  1e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4397  sulfate transporter subunit  54.61 
 
 
329 aa  351  1e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1394  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  56.63 
 
 
338 aa  351  1e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4118  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  51.01 
 
 
359 aa  351  1e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000140992  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1578  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  57.32 
 
 
345 aa  350  1e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2760  thiosulphate-binding protein  52.87 
 
 
329 aa  350  2e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.997597 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0392  sulfate/thiosulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  54.72 
 
 
337 aa  350  2e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0560  sulfate-binding protein precursor  54.72 
 
 
337 aa  350  2e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.845456  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1636  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  57.32 
 
 
345 aa  350  2e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.778191  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1183  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  52.94 
 
 
336 aa  350  2e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1011  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  52.96 
 
 
351 aa  350  2e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1121  thiosulphate-binding protein  57.32 
 
 
345 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0371  sulfate/thiosulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  54.72 
 
 
337 aa  350  2e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.597645  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1601  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  57.32 
 
 
345 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0563  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  52.85 
 
 
341 aa  349  4e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.201199  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0866  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  54.98 
 
 
334 aa  349  5e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1517  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  57.32 
 
 
345 aa  348  6e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.485355  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1369  thiosulphate-binding protein  55.35 
 
 
335 aa  348  6e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0327074  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1497  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  57.32 
 
 
345 aa  348  6e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2105  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  55.08 
 
 
341 aa  348  6e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4739  thiosulphate-binding protein  57.01 
 
 
345 aa  348  7e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0623695  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0122  thiosulfate binding protein  55.99 
 
 
337 aa  348  8e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.964738  decreased coverage  0.00000712106 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1125  sulfate-binding protein  52.66 
 
 
351 aa  348  1e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0967  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  52.15 
 
 
337 aa  348  1e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1196  sulfate ABC transporter, sulfate/thiosulfate-binding protein  52.96 
 
 
351 aa  347  2e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4055  sulfate transporter subunit  54.28 
 
 
329 aa  347  2e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.868359  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2376  thiosulphate-binding protein  51.37 
 
 
330 aa  346  4e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.735405 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2992  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  52.27 
 
 
339 aa  345  6e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4410  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  53.59 
 
 
342 aa  344  1e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.476755  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1044  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  52.63 
 
 
336 aa  344  1e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>