53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3746 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_3746  dTDP-6-deoxy-L-hexose 3-O-methyltransferase  100 
 
 		 240 aa  485  1e-136  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.521801 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4223  dTDP-6-deoxy-L-hexose 3-O-methyltransferase  40.49 
 
 		 273 aa  157  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4841  hypothetical protein  36.65 
 
 		 268 aa  127  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.781008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2763  dTDP-6-deoxy-L-hexose 3-O-methyltransferase  36.41 
 
 		 222 aa  122  6e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.076486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2046  hypothetical protein  34.12 
 
 		 257 aa  121  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.15378  hitchhiker  0.00220889 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2056  hypothetical protein  33.49 
 
 		 257 aa  119  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0742  dTDP-6-deoxy-L-hexose 3-O-methyltransferase  33.51 
 
 		 251 aa  119  4.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0248  dTDP-6-deoxy-L-hexose 3-O-methyltransferase  34.15 
 
 		 276 aa  112  6e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.323725  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27720  dTDP-6-deoxy-L-hexose 3-O-methyltransferase  42.86 
 
 		 143 aa  103  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.26265  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3108  hypothetical protein  31.03 
 
 		 252 aa  99.4  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3751  hypothetical protein  28.88 
 
 		 259 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.186525 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4404  hypothetical protein  26.89 
 
 		 273 aa  86.7  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0147  hypothetical protein  26.19 
 
 		 261 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0160  hypothetical protein  26.19 
 
 		 261 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.899494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3337  hypothetical protein  27.12 
 
 		 260 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.370966 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2577  macrocin-O-methyltransferase domain-containing protein  30.13 
 
 		 268 aa  68.9  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000150088  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1203  putative methyltransferase  31.15 
 
 		 266 aa  66.6  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.139767  normal  0.896147 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2848  macrocin-O-methyltransferase domain-containing protein  24.64 
 
 		 261 aa  64.3  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.360921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4202  hypothetical protein  26.82 
 
 		 250 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.994524 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3453  macrocin-O-methyltransferase domain-containing protein  25.82 
 
 		 485 aa  58.9  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2025  hypothetical protein  21.61 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0641  hypothetical protein  29.1 
 
 		 286 aa  56.2  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0804616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5242  hypothetical protein  26.01 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.019453  normal  0.202223 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2468  hypothetical protein  29.8 
 
 		 281 aa  55.5  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.789559  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1291  macrocin-O-methyltransferase  23.59 
 
 		 291 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1835  putative methyltransferase  27.44 
 
 		 258 aa  52.8  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0698  hypothetical protein  29.73 
 
 		 227 aa  51.6  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.658114  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0551  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing), putative  27.93 
 
 		 224 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0539  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing), putative  27.93 
 
 		 224 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.646153  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3365  hypothetical protein  29.01 
 
 		 246 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.668804  normal  0.0254427 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2171  hypothetical protein  29.56 
 
 		 213 aa  50.1  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.3355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_55206  macrocin o-methyltransferase domain-containing protein  26.58 
 
 		 349 aa  50.4  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4288  hypothetical protein  30.52 
 
 		 282 aa  50.1  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.414495  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0529  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing), putative  27.37 
 
 		 224 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2419  macrocin-O-methyltransferase  24.88 
 
 		 277 aa  48.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0597  hypothetical protein  24.4 
 
 		 218 aa  48.5  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2761  hypothetical protein  27.53 
 
 		 434 aa  48.1  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4080  macrocin O-methyltransferase  24.36 
 
 		 281 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.310855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1318  hypothetical protein  26.46 
 
 		 227 aa  46.6  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.575066  hitchhiker  0.000000517485 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2516  methyltransferase  24.19 
 
 		 230 aa  47  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.524649  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0930  macrocin-O-methyltransferase  22.75 
 
 		 281 aa  46.2  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3940  macrocin-O-methyltransferase  25.65 
 
 		 301 aa  46.2  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.881995  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1261  macrocin O-methyltransferase  23.72 
 
 		 281 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45110  predicted protein  21.89 
 
 		 345 aa  45.4  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1366  TPR repeat-containing protein  27.33 
 
 		 402 aa  45.4  0.0008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.104941  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1116  macrocin-O-methyltransferase  23.72 
 
 		 281 aa  44.7  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2907  hypothetical protein  26.97 
 
 		 434 aa  44.7  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3219  hypothetical protein  22.71 
 
 		 322 aa  43.5  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1480  hypothetical protein  27.63 
 
 		 232 aa  43.5  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.213383  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5468  hypothetical protein  25 
 
 		 252 aa  43.5  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5642  hypothetical protein  28.84 
 
 		 316 aa  43.1  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3359  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  23.01 
 
 		 246 aa  42.4  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.13053  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1328  bacteriocin O-metyltransferase, putative  22.73 
 
 		 281 aa  42  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>