20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3565 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_3565  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 252 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4246  periplasmic binding protein  84.52 
 
 		 266 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1622  extracellular solute-binding protein  83.47 
 
 		 266 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.12881 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3812  extracellular solute-binding protein  85.26 
 
 		 266 aa  424  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3943  periplasmic binding protein  69 
 
 		 277 aa  336  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2686  extracellular solute-binding protein  62.66 
 
 		 263 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0129689  normal  0.492762 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2024  hypothetical protein  64.13 
 
 		 279 aa  302  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.20438  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1833  hypothetical protein  58.87 
 
 		 279 aa  295  6e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.432848 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2687  hypothetical protein  49.38 
 
 		 261 aa  247  1e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0951528  normal  0.504159 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1473  hypothetical protein  40.16 
 
 		 268 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2113  hypothetical protein  38.43 
 
 		 265 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.018771  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1618  hypothetical protein  38.26 
 
 		 268 aa  181  1e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1878  amino acid ABC transporter periplasmic protein  38.56 
 
 		 246 aa  176  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.201916  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1839  hypothetical protein  36.18 
 
 		 275 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1807  hypothetical protein  36.12 
 
 		 276 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1854  hypothetical protein  36.12 
 
 		 281 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.549839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2471  hypothetical protein  36.12 
 
 		 281 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.519475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1815  hypothetical protein  35.68 
 
 		 276 aa  149  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4554  hypothetical protein  35.44 
 
 		 243 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3738  sensor histidine kinase/response regulator  25.64 
 
 		 917 aa  43.5  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.410794  normal  0.466672 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>