More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4950 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4950  hypothetical protein  100 
 
 		 157 aa  318  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.070486  normal  0.198333 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4898  hypothetical protein  96.18 
 
 		 157 aa  307  4e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.44547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4774  hypothetical protein  96.18 
 
 		 157 aa  307  4e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.431591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4689  hypothetical protein  92.99 
 
 		 157 aa  301  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07500  ATPase, with role in cell wall biosynthesis  75.5 
 
 		 156 aa  242  9.999999999999999e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0610132  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0631  hypothetical protein  76.32 
 
 		 155 aa  242  9.999999999999999e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.40036 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0519  hypothetical protein  80.29 
 
 		 143 aa  233  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0120244  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0568  hypothetical protein  76.76 
 
 		 143 aa  232  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4946  hypothetical protein  74.65 
 
 		 142 aa  225  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5677  hypothetical protein  69.54 
 
 		 155 aa  221  3e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.178555  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65380  hypothetical protein  68.87 
 
 		 155 aa  219  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0610791  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0321  hypothetical protein  57.14 
 
 		 162 aa  186  1e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4635  putative ATPase  56.85 
 
 		 153 aa  177  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00161848  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4718  putative ATPase  56.85 
 
 		 153 aa  177  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.983496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4754  putative ATPase  56.85 
 
 		 152 aa  177  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.382277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4775  putative ATPase  56.85 
 
 		 152 aa  177  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0594287 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0351  putative ATPase  55.26 
 
 		 153 aa  177  7e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000572111  hitchhiker  0.00108821 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4625  putative ATPase  56.85 
 
 		 152 aa  177  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04035  ATPase with strong ADP affinity  57.93 
 
 		 153 aa  175  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000985798  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3825  protein of unknown function UPF0079  57.93 
 
 		 153 aa  175  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000776436  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03997  hypothetical protein  57.93 
 
 		 153 aa  175  2e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000527155  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4725  putative ATPase  57.93 
 
 		 153 aa  175  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000010993  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4410  putative ATPase  57.93 
 
 		 153 aa  175  2e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000607313  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5684  putative ATPase  57.93 
 
 		 152 aa  175  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000102371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3845  putative ATPase  57.93 
 
 		 153 aa  175  2e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000032368  hitchhiker  0.00000180276 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4639  putative ATPase  57.93 
 
 		 152 aa  175  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.162208  normal  0.0835245 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4699  putative ATPase  57.93 
 
 		 153 aa  175  2e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000112747  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0562  hypothetical protein  51.59 
 
 		 157 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000200674  normal  0.209641 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0427  putative ATPase  58.33 
 
 		 156 aa  171  5e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000368421  hitchhiker  0.000000532779 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0488  protein of unknown function UPF0079  54.78 
 
 		 160 aa  170  5.999999999999999e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000100685  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0703  putative ATPase  60.9 
 
 		 156 aa  170  7.999999999999999e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000204367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3803  putative ATPase  60.9 
 
 		 156 aa  170  7.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000296648  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00098  hypothetical protein  54.17 
 
 		 154 aa  169  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3657  putative ATPase  60.9 
 
 		 156 aa  169  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000030083  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002255  ATPase YjeE  54.17 
 
 		 154 aa  169  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000336436  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2781  hypothetical protein  53.47 
 
 		 154 aa  169  2e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3725  putative ATPase  55.48 
 
 		 160 aa  167  6e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0265653  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3923  putative ATPase  55.48 
 
 		 160 aa  167  6e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00130971  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3714  protein of unknown function UPF0079  54.3 
 
 		 152 aa  167  7e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3897  hypothetical protein  54.3 
 
 		 152 aa  167  7e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000307374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0554  hypothetical protein  54.3 
 
 		 152 aa  167  7e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971051  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3771  hypothetical protein  54.3 
 
 		 152 aa  167  7e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000107911  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3974  hypothetical protein  52.35 
 
 		 153 aa  165  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3284  hypothetical protein  52.32 
 
 		 152 aa  166  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000351541  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2754  hypothetical protein  54.74 
 
 		 188 aa  166  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000152007  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1300  hypothetical protein  56.83 
 
 		 144 aa  163  6.9999999999999995e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0581872  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3544  hypothetical protein  51.95 
 
 		 160 aa  163  9e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1081  ATPase  52.08 
 
 		 156 aa  160  7e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0531  protein of unknown function UPF0079  59.84 
 
 		 157 aa  159  1e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0352512  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0594  hypothetical protein  51.66 
 
 		 152 aa  159  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997285  hitchhiker  0.000000403865 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0593  hypothetical protein  51.66 
 
 		 152 aa  159  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0559818  hitchhiker  0.0000222246 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0599  hypothetical protein  50.99 
 
 		 152 aa  158  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3029  hypothetical protein  50.33 
 
 		 153 aa  159  2e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.63375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2773  hypothetical protein  53.95 
 
 		 165 aa  157  4e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.018672  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3436  hypothetical protein  50.99 
 
 		 152 aa  158  4e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000774396  normal  0.208239 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0793  hypothetical protein  49.01 
 
 		 152 aa  157  6e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.949281  hitchhiker  0.00232347 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1273  hypothetical protein  52.67 
 
 		 159 aa  157  7e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3315  hypothetical protein  51.37 
 
 		 152 aa  157  8e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00300444  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2636  hypothetical protein  55.15 
 
 		 153 aa  156  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00016395  hitchhiker  0.000000000107728 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2671  RNA binding S1  48.65 
 
 		 157 aa  154  3e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.543969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3209  hypothetical protein  53.62 
 
 		 157 aa  155  3e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000564317  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3242  hypothetical protein  57.14 
 
 		 152 aa  154  7e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0893  protein of unknown function UPF0079  51.68 
 
 		 156 aa  153  9e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.419695  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4174  hypothetical protein  47.59 
 
 		 152 aa  152  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00645  ATP/GTP hydrolase  52.71 
 
 		 160 aa  147  8e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1380  hypothetical protein  53.45 
 
 		 127 aa  141  4e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0569  hypothetical protein  52.05 
 
 		 167 aa  138  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000405356 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0492  protein of unknown function UPF0079  53.79 
 
 		 155 aa  138  3e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.069952  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2410  protein of unknown function UPF0079  52.67 
 
 		 192 aa  133  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1784  protein of unknown function UPF0079  41.83 
 
 		 176 aa  132  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0485483  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2531  hypothetical protein  47.18 
 
 		 162 aa  131  3e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2816  protein of unknown function UPF0079  53.44 
 
 		 192 aa  131  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.559153  normal  0.894815 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0723  hypothetical protein  45.57 
 
 		 184 aa  130  6e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2501  hypothetical protein  44.94 
 
 		 184 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2540  hypothetical protein  53.12 
 
 		 198 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0366  hypothetical protein  44.94 
 
 		 184 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1065  hypothetical protein  44.94 
 
 		 184 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0878118  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0911  hypothetical protein  44.94 
 
 		 184 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0115  hypothetical protein  44.94 
 
 		 184 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0666  hypothetical protein  44.94 
 
 		 184 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.739663  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0908  hypothetical protein  44.94 
 
 		 184 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2586  hypothetical protein  44.52 
 
 		 171 aa  128  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0365386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5894  hypothetical protein  44.52 
 
 		 184 aa  128  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.51818 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2481  hypothetical protein  46.45 
 
 		 183 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0482851 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1951  hypothetical protein  44.52 
 
 		 171 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.286384  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2562  hypothetical protein  44.52 
 
 		 198 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0734  hypothetical protein  44.52 
 
 		 184 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2610  hypothetical protein  45.81 
 
 		 198 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0520  hypothetical protein  43.95 
 
 		 184 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0338  hypothetical protein  49.31 
 
 		 152 aa  124  6e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000369784  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1598  protein of unknown function UPF0079  50.42 
 
 		 161 aa  122  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.86964  normal  0.106509 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1926  conserved hypothetical protein TIGR00150  50.42 
 
 		 161 aa  122  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3050  hypothetical protein  49.18 
 
 		 153 aa  121  4e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.664938  normal  0.025275 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2627  hypothetical protein  38.93 
 
 		 160 aa  120  7e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3302  hypothetical protein  45.39 
 
 		 183 aa  120  7e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.749162  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2754  hypothetical protein  38.93 
 
 		 160 aa  120  8e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3215  protein of unknown function UPF0079  41.92 
 
 		 194 aa  118  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0818  hypothetical protein  42 
 
 		 161 aa  117  3.9999999999999996e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000019093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0747  hypothetical protein  42.42 
 
 		 192 aa  117  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0670  hypothetical protein  52.38 
 
 		 155 aa  114  3.9999999999999997e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.169194  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>