25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1873 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1873  hypothetical protein  100 
 
 		 110 aa  208  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1719  putative iron uptake protein  73.79 
 
 		 110 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36960  hypothetical protein  63.22 
 
 		 112 aa  107  6e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221068  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0264  hypothetical protein  36.36 
 
 		 107 aa  60.1  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442595  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4468  hypothetical protein  40.74 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4609  hypothetical protein  41.58 
 
 		 108 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25310  membrane protein  37.93 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0928  hypothetical protein  38.82 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.966724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4591  hypothetical protein  43.14 
 
 		 108 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1323  hypothetical protein  33.67 
 
 		 109 aa  51.2  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.127527 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1212  hypothetical protein  38.2 
 
 		 110 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0855  hypothetical protein  42.53 
 
 		 108 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.669477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1146  hypothetical protein  39.73 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.279583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1217  hypothetical protein  39.73 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1147  hypothetical protein  39.73 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.46677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1312  hypothetical protein  39.19 
 
 		 116 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.234542  normal  0.43387 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3078  hypothetical protein  39.19 
 
 		 116 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.963714  hitchhiker  0.0016345 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1279  hypothetical protein  39.19 
 
 		 116 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.617741  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2729  hypothetical protein  39.73 
 
 		 118 aa  45.1  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1235  hypothetical protein  39.19 
 
 		 116 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.145276  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0148  putative iron uptake protein  34.21 
 
 		 115 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.157544 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4599  putative iron uptake protein  42.65 
 
 		 116 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.131243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1107  hypothetical protein  37.5 
 
 		 120 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.319028 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3408  hypothetical protein  37.33 
 
 		 117 aa  41.2  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1221  hypothetical protein  32.56 
 
 		 108 aa  40.8  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>