More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1800 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1800  hypothetical protein  100 
 
 
435 aa  882    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10210  putative oxidoreductase  71.82 
 
 
435 aa  631  1e-180  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.977198  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3146  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  69.98 
 
 
436 aa  615  1e-175  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00299695  hitchhiker  0.0000446713 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4088  hypothetical protein  61.01 
 
 
434 aa  530  1e-149  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.454029  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3526  hypothetical protein  59.26 
 
 
433 aa  499  1e-140  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3605  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A  44.11 
 
 
432 aa  371  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1596  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  43.78 
 
 
432 aa  372  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3014  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  52.51 
 
 
394 aa  317  3e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.152708  normal  0.872356 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1126  nitrilotriacetate monooxygenase component A  38.28 
 
 
453 aa  243  3e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2352  nitrilotriacetate monooxygenase, A subunit, putative  38.4 
 
 
434 aa  242  9e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.742121  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22400  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit protein  36.04 
 
 
453 aa  239  9e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4938  putative monooxygenase  37.5 
 
 
451 aa  238  2e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131533  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1558  nitrilotriacetate monooxygenase subunit A  34.87 
 
 
458 aa  238  2e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1853  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  34.4 
 
 
456 aa  236  4e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2409  hypothetical protein  37.27 
 
 
454 aa  233  5e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2568  nitrilotriacetate monooxygenase component A (NtA monooxygenase component A) (NtA-MO A)  35.02 
 
 
447 aa  231  2e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1550  putative nitrilotriacetate monooxygenase subunit A  35.16 
 
 
451 aa  228  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.12121  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43950  monoxygenase, NtaA/DszA family  35.91 
 
 
448 aa  228  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.182023  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3283  nitrilotriacetate monooxygenase component A (NtA monooxygenase component A) (NtA-MO A)  35.09 
 
 
474 aa  228  2e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4106  nitrilotriacetate monooxygenase  36.22 
 
 
445 aa  227  4e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43930  monooxygenase, NtaA/SnaA/SoxA/DszA family  36.04 
 
 
444 aa  222  9.999999999999999e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1784  nitrilotriacetate monooxygenase component A  36.05 
 
 
429 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.156784  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2658  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  33.56 
 
 
439 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.104132  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4825  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  34.34 
 
 
441 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4142  monooxygenase-like  32.44 
 
 
454 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.279616  normal  0.0146609 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1381  xenobiotic compound DszA family monooxygenase  32.88 
 
 
440 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.559516  normal  0.652987 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3854  putative monooxygenase  35.12 
 
 
492 aa  220  3.9999999999999997e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.436036  normal  0.791068 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2175  nitrilotriacetate monooxygenase component A  34.7 
 
 
445 aa  219  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01780  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  35.99 
 
 
447 aa  218  2e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3282  nitrilotriacetate monooxygenase component A  33.18 
 
 
459 aa  218  2e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3452  putative monooxygenase  35.95 
 
 
447 aa  218  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000752171 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1849  nitrilotriacetate monooxygenase component A  34.55 
 
 
452 aa  217  2.9999999999999998e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.896869  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0105  nitrilotriacetate monooxygenase component A  34.84 
 
 
448 aa  216  5.9999999999999996e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00568077 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0251  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  34.55 
 
 
439 aa  216  7e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.441756 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0349  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit  34.11 
 
 
441 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4521  monooxygenase-like protein  31.74 
 
 
455 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.81326 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2676  nitrilotriacetate monooxygenase component A (NtA monooxygenase component A) (NtA-MO A)  33.03 
 
 
448 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29430  nitrilotriacetate monooxygenase  35.44 
 
 
436 aa  215  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.64384  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6404  nitrilotriacetate monooxygenase component A  31.66 
 
 
457 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0247936  normal  0.261136 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21340  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit  32.56 
 
 
450 aa  214  3.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.341615  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2100  putative xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A, NtaA/SnaA/SoxA/DszA family  34.55 
 
 
457 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5176  monooxygenase  35.15 
 
 
429 aa  213  4.9999999999999996e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0160  putative monooxygenase  34.79 
 
 
469 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1300  putative nitrilotriacetate monooxygenase  34.31 
 
 
451 aa  212  9e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0896409  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8274  monooxygenase  36.2 
 
 
442 aa  210  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.104481 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0150  putative monooxygenase  33.11 
 
 
445 aa  211  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.323467 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05546  Putative C2H2 finger domain transcription factor (Eurofung)  34.31 
 
 
1121 aa  210  4e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5962  nitrilotriacetate monooxygenase  33.41 
 
 
453 aa  210  4e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3494  nitrilotriacetate monooxygenase component A  34.8 
 
 
460 aa  210  4e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.748879 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3188  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  34 
 
 
446 aa  209  5e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4419  nitrilotriacetate monooxygenase  35.7 
 
 
455 aa  209  5e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.332959  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3435  Nrd protein  34.62 
 
 
444 aa  209  7e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.218631 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7232  xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A  34.69 
 
 
458 aa  208  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177104  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3782  nitrilotriacetate monooxygenase  33.49 
 
 
455 aa  208  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1266  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  32.13 
 
 
457 aa  207  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.476784  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4356  nitrilotriacetate monooxygenase component A  34.4 
 
 
449 aa  207  2e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.191629  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4844  Nrd protein  34.83 
 
 
448 aa  207  3e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.426791  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1693  putative monooxygenase  33.78 
 
 
449 aa  206  5e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0841245  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4307  putative nitrilotriacetate monooxygenase  33.1 
 
 
449 aa  206  6e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.355403  hitchhiker  0.00147548 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2378  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  31.74 
 
 
440 aa  206  7e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1851  nitrilotriacetate monooxygenase component A  33.26 
 
 
452 aa  206  7e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2156  xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A  34.09 
 
 
458 aa  206  9e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3116  Nrd protein  34.39 
 
 
444 aa  206  9e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3332  putative monooxygenase  34.48 
 
 
451 aa  205  1e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4857  nitrilotriacetate monooxygenase component A  36.1 
 
 
449 aa  205  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.140464  normal  0.511595 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3891  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  33.41 
 
 
439 aa  204  2e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.68944  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3292  nitrilotriacetate monooxygenase component A  33.48 
 
 
447 aa  204  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.451548  normal  0.084467 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4640  nitrilotriacetate monooxygenase protein, component A  35.18 
 
 
452 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6020  xenobiotic compound DszA family monooxygenase  33.26 
 
 
443 aa  204  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.719059 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7195  monooxygenase  33.93 
 
 
443 aa  204  3e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0485069  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1773  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A protein  31.76 
 
 
448 aa  204  3e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.702307  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21740  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit  35.25 
 
 
442 aa  204  4e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.77772  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3311  Nrd protein  34.39 
 
 
457 aa  203  5e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6653  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A  33.18 
 
 
448 aa  203  6e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.743567  normal  0.503054 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1369  luciferase-like protein  34.25 
 
 
454 aa  202  7e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.174728  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1544  luciferase-like protein  35.73 
 
 
449 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.324822 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0268  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A  32.35 
 
 
448 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2529  putative monooxygenase  34.24 
 
 
450 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2773  xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A  32.66 
 
 
452 aa  200  5e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6442  monooxygenase protein  35.75 
 
 
451 aa  199  7e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.01748 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0770  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  32.39 
 
 
450 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4213  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A protein  29.98 
 
 
449 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2318  nitrilotriacetate monooxygenase component A  33.56 
 
 
431 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0200  hypothetical protein  31.09 
 
 
434 aa  197  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2556  nitrilotriacetate monooxygenase component A  31.95 
 
 
455 aa  197  2.0000000000000003e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1731  putative EDTA monooxygenase  33.56 
 
 
431 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.136958  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0779  putative nitrilotriacetate monooxygenase  33.56 
 
 
431 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000264103  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1847  putative EDTA monooxygenase  33.56 
 
 
431 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00146661  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0518  putative EDTA monooxygenase  33.56 
 
 
431 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.043498  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1639  putative EDTA monooxygenase  33.56 
 
 
431 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0538792  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2361  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  30.66 
 
 
441 aa  196  5.000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.43651  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2448  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A  34.7 
 
 
495 aa  196  7e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2024  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  30.79 
 
 
460 aa  196  8.000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1255  nitrilotriacetate monooxygenase component A  34.7 
 
 
468 aa  196  9e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1181  nitrilotriacetate monooxygenase component A  34.7 
 
 
468 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2283  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  33.64 
 
 
440 aa  196  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.161392 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0906  nitrilotriacetate monooxygenase component A  33.71 
 
 
441 aa  195  1e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.457793  normal  0.708091 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2456  nitrilotriacetate monooxygenase component A  33.33 
 
 
431 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00745552  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5125  putative monooxygenase protein  32.3 
 
 
450 aa  194  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5298  Nrd protein  33.33 
 
 
461 aa  195  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0826228  normal  0.019429 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>