17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0799 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_0799  hypothetical protein  100 
 
 		 86 aa  169  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.829636 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4431  hypothetical protein  88.37 
 
 		 86 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0785  hypothetical protein  83.72 
 
 		 86 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4717  hypothetical protein  72.09 
 
 		 86 aa  130  9e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.813959  normal  0.441756 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3671  hypothetical protein  69.77 
 
 		 86 aa  118  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0982  hypothetical protein  61.63 
 
 		 86 aa  110  5e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0283984  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1142  hypothetical protein  59.3 
 
 		 86 aa  106  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0991751  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61340  hypothetical protein  62.07 
 
 		 87 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.422961 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5282  hypothetical protein  60.92 
 
 		 87 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.587744  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1068  hypothetical protein  41.67 
 
 		 264 aa  57.8  0.00000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.697247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1474  hypothetical protein  43.66 
 
 		 105 aa  49.7  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0666349  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2697  hypothetical protein  43.75 
 
 		 106 aa  47.4  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2888  hypothetical protein  41.67 
 
 		 105 aa  47.4  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.663945  hitchhiker  0.000042326 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2333  hypothetical protein  44.62 
 
 		 105 aa  45.4  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.101218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1760  hypothetical protein  41.54 
 
 		 105 aa  45.4  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0207177  normal  0.0104849 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0683  hypothetical protein  31.34 
 
 		 87 aa  42.7  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.740334  normal  0.446844 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2164  hypothetical protein  31.82 
 
 		 74 aa  40.8  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>