51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3812 on replicon NC_008607
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008607  Ppro_3812  transposase, IS605 OrfB  100 
 
 
664 aa  1371    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3650  transposase IS605 OrfB  25.74 
 
 
536 aa  94.7  5e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1540  IS605 family transposase OrfB  29.75 
 
 
223 aa  53.9  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1677  putative transposase IS605 family  27.68 
 
 
449 aa  52.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4737  IS605 family transposase OrfB  28.85 
 
 
371 aa  52  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1058  IS605 family transposase OrfB  28.85 
 
 
355 aa  51.2  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.14172 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3151  IS605 family transposase OrfB  28.85 
 
 
355 aa  50.4  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0201  IS605 family transposase OrfB  29.56 
 
 
385 aa  50.4  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000194492  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3363  IS605 family transposase OrfB  30.92 
 
 
350 aa  48.5  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.684311  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3396  IS605 family transposase OrfB  27.85 
 
 
385 aa  48.1  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000848869  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6014  IS605 family transposase OrfB  30.26 
 
 
350 aa  47.8  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2243  transposase, IS605 OrfB family  26.62 
 
 
424 aa  47.4  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6476  IS605 family transposase OrfB  29.61 
 
 
350 aa  47  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.037222  normal  0.870894 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1159  transposase, IS605 OrfB family  30.26 
 
 
416 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5135  IS605 family transposase OrfB  29.61 
 
 
353 aa  47.4  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.767848  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5338  IS605 family transposase OrfB  29.61 
 
 
350 aa  47  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.522659 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1192  IS605 family transposase OrfB  29.56 
 
 
353 aa  47  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0334  transposase  28.22 
 
 
372 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0713  transposase, IS605 OrfB  29.56 
 
 
353 aa  47  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.429741  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0601  transposase, IS605 OrfB family  25 
 
 
399 aa  45.8  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.0000137299  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2633  transposase, IS605 OrfB family  25 
 
 
372 aa  46.2  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.56671  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5305  IS605 family transposase OrfB  29.61 
 
 
350 aa  45.8  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0621738  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0445  transposase  28.22 
 
 
372 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0182  IS605 family transposase OrfB  25 
 
 
383 aa  45.8  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2454  transposase, IS605 OrfB family  25 
 
 
395 aa  45.4  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.1066  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6095  IS605 family transposase OrfB  29.61 
 
 
350 aa  45.8  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3834  IS605 family transposase OrfB  29.61 
 
 
350 aa  45.4  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.885241 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0022  IS891/IS1136/IS1341 transposase  23.08 
 
 
374 aa  45.8  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0682422 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2446  IS605 family transposase OrfB  26.88 
 
 
383 aa  45.4  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.327325  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5544  transposase, IS605 OrfB  29.61 
 
 
350 aa  45.8  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.518221  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3911  IS605 family transposase OrfB  28.95 
 
 
350 aa  45.4  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5909  IS605 family transposase OrfB  29.61 
 
 
350 aa  45.8  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4247  IS605 family transposase OrfB  29.61 
 
 
350 aa  45.4  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.866566  normal  0.0328861 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5061  IS605 family transposase OrfB  28.95 
 
 
350 aa  45.4  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.149443  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1049  ISCpe2, transposase orfB  28.95 
 
 
384 aa  45.1  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00154487  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4780  transposase, IS605 OrfB  28.95 
 
 
350 aa  45.1  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3387  IS605 family transposase OrfB  28.95 
 
 
350 aa  45.1  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0180  transposase  27.65 
 
 
373 aa  45.1  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0390004  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4129  IS605 family transposase OrfB  28.95 
 
 
350 aa  45.1  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.426734 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6181  IS605 family transposase OrfB  28.95 
 
 
350 aa  45.1  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.252377  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1583  ISCpe2, transposase orfB  29.61 
 
 
384 aa  44.7  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0166589  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0263  IS605 family transposase OrfB  28.29 
 
 
382 aa  44.7  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00049231  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5405  IS605 family transposase OrfB  29.61 
 
 
350 aa  44.7  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606639  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0597  transposase, IS605 OrfB family  24.26 
 
 
374 aa  44.7  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000997644  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0889  ISCpe2, transposase orfB  28.95 
 
 
384 aa  44.3  0.007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.688854  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2028  IS605 family transposase OrfB  28.29 
 
 
350 aa  44.3  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0971248  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6049  transposase, IS605 OrfB  28.29 
 
 
350 aa  44.3  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.738154  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1565  ISCpe2, transposase orfB  28.95 
 
 
384 aa  43.9  0.009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1513  IS605 family transposase OrfB  25.36 
 
 
405 aa  43.9  0.009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0963227  normal  0.774713 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0404  transposase  28.37 
 
 
259 aa  43.9  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5122  IS605 family transposase OrfB  29.61 
 
 
353 aa  43.9  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.331521 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>