33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2867 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2867  hypothetical protein  100 
 
 
98 aa  191  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3177  hypothetical protein  56.96 
 
 
100 aa  102  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1084  hypothetical protein  54.43 
 
 
100 aa  99.4  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.482733  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1208  hypothetical protein  47.44 
 
 
84 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0491  hypothetical protein  51.28 
 
 
107 aa  82.4  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4335  hypothetical protein  48 
 
 
88 aa  81.3  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0148994  hitchhiker  0.00593874 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1246  hypothetical protein  47.44 
 
 
84 aa  81.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2385  hypothetical protein  46.84 
 
 
83 aa  81.3  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2790  hypothetical protein  42.31 
 
 
84 aa  78.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2883  hypothetical protein  46.67 
 
 
89 aa  76.6  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3647  hypothetical protein  49.33 
 
 
107 aa  76.6  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.839575  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2863  hypothetical protein  42.31 
 
 
87 aa  76.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.444937  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2955  hypothetical protein  42.31 
 
 
87 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4495  hypothetical protein  44.87 
 
 
89 aa  66.6  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0559  acyl carrier protein  35.06 
 
 
85 aa  58.9  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13352e-20 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0547  acyl carrier protein  35.06 
 
 
85 aa  58.9  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.962654  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4316  hypothetical protein  38.67 
 
 
81 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1176  hypothetical protein  40 
 
 
83 aa  49.3  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.135395  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0275  hypothetical protein  33.33 
 
 
83 aa  47  0.00008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0227705  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0266  hypothetical protein  30.67 
 
 
81 aa  46.2  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3412  hypothetical protein  33.9 
 
 
84 aa  45.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70735  normal  0.137668 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0719  hypothetical protein  32.76 
 
 
89 aa  45.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0230669  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0987  hypothetical protein  38.57 
 
 
79 aa  45.4  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5319  hypothetical protein  36.49 
 
 
90 aa  45.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0732  hypothetical protein  32.76 
 
 
89 aa  44.7  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000191496 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2021  hypothetical protein  30.51 
 
 
78 aa  44.3  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.272173 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1194  hypothetical protein  34.72 
 
 
88 aa  43.9  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.48809  normal  0.529415 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2354  hypothetical protein  33.75 
 
 
85 aa  43.5  0.0009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3969  hypothetical protein  37.93 
 
 
85 aa  43.5  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.505246  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0975  acyl carrier protein  35.62 
 
 
80 aa  42  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.553759  normal  0.616153 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1641  acyl carrier protein  32.88 
 
 
82 aa  41.6  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0713  acyl carrier protein  30.67 
 
 
78 aa  40.4  0.008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000031745  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0944  acyl carrier protein  34.67 
 
 
79 aa  40  0.01  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000174331  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>