29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2771 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2771  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 
143 aa  300  6.000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0423  hypothetical protein  52.86 
 
 
152 aa  162  1.0000000000000001e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.415551  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1680  hypothetical protein  50.7 
 
 
145 aa  142  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.237094  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3064  histidine triad (HIT) protein  54.47 
 
 
163 aa  140  6e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.284602 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2239  histidine triad (HIT) protein  53.44 
 
 
142 aa  133  9e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1308  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolase-like protein  53.91 
 
 
210 aa  131  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40379  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5427  hypothetical protein  62.03 
 
 
168 aa  98.6  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3237  histidine triad (HIT) protein  32.22 
 
 
139 aa  48.5  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3617  histidine triad (HIT) protein  27.83 
 
 
144 aa  46.6  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0406  histidine triad (HIT) protein  29.9 
 
 
140 aa  45.8  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2734  histidine triad (HIT) protein  37.04 
 
 
147 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.587938  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2122  histidine triad (HIT) protein  37.04 
 
 
147 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.427523  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2761  histidine triad (HIT) protein  37.04 
 
 
147 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2785  histidine triad (HIT) protein  35.8 
 
 
147 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.804661  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6061  histidine triad (HIT) protein  37.04 
 
 
147 aa  44.7  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2652  histidine triad (HIT) protein  35.8 
 
 
147 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.627712  normal  0.962372 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0565  histidine triad (HIT) protein  37.04 
 
 
147 aa  44.7  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.419431  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4120  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 
143 aa  43.9  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4476  putative histidine triad (HIT) protein  30.43 
 
 
141 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000626279 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0551  HIT domain-containing protein  34.57 
 
 
152 aa  40.8  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0681  HIT domain-containing protein  30.48 
 
 
152 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2396  HIT domain-containing protein  30.48 
 
 
152 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0665  HIT domain-containing protein  30.48 
 
 
152 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2316  HIT domain-containing protein  30.48 
 
 
152 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.529616  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0559  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase  31.37 
 
 
128 aa  40.4  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.344449 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2762  HIT domain-containing protein  30.48 
 
 
152 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0604748  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0843  HIT family hydrolase  30.48 
 
 
152 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0184  hypothetical protein  30.48 
 
 
152 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3912  histidine triad (HIT) protein  25.56 
 
 
142 aa  40.4  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000268802  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>