14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0997 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0997  type IV pilus assembly PilZ  100 
 
 		 96 aa  198  3e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0336  type IV pilus assembly PilZ  33.75 
 
 		 121 aa  61.6  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.11727  normal  0.442913 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3538  type IV pilus assembly PilZ  29.27 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.95564  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1008  type IV pilus assembly PilZ  37.68 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.040213  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1192  hypothetical protein  30.59 
 
 		 124 aa  57  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0114728  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0950  type IV pilus assembly PilZ  30 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0622981  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3252  type IV pilus assembly PilZ  36.23 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0923  type IV pilus assembly PilZ  31.71 
 
 		 124 aa  52  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0312  hypothetical protein  27.06 
 
 		 92 aa  51.2  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2430  type IV pilus assembly PilZ  37.18 
 
 		 117 aa  50.8  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.232647  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0114  hypothetical protein  30.14 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0200931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1460  hypothetical protein  32.88 
 
 		 115 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0918773  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3298  type IV pilus assembly PilZ  22.09 
 
 		 124 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000457496  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0852  type IV pilus assembly PilZ  23.29 
 
 		 356 aa  40.4  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.513367  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>