25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0790 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_0790  hypothetical protein  100 
 
 
269 aa  543  1e-153  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000900967  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1242  hypothetical protein  61.22 
 
 
286 aa  304  8.000000000000001e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0303154  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1788  hypothetical protein  57.25 
 
 
264 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000868196  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1782  hypothetical protein  57.25 
 
 
264 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.393989  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1059  hypothetical protein  36.84 
 
 
263 aa  150  2e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.269022  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2004  hypothetical protein  34.09 
 
 
266 aa  146  3e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00153621  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0487  hypothetical protein  34.4 
 
 
263 aa  133  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.38522  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0352  hypothetical protein  35.6 
 
 
248 aa  117  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0325  hypothetical protein  33.83 
 
 
259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.391296  normal  0.511611 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1280  hypothetical protein  27.42 
 
 
247 aa  89.7  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106415  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3994  hypothetical protein  25.81 
 
 
247 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.900475  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4458  hypothetical protein  26.21 
 
 
247 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4078  hypothetical protein  28.57 
 
 
246 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.682161  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1419  hypothetical protein  28.98 
 
 
302 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.136441  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1340  hypothetical protein  28.34 
 
 
247 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1251  hypothetical protein  28.34 
 
 
247 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1422  hypothetical protein  28.34 
 
 
247 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.727382  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0496  hypothetical protein  28.34 
 
 
247 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.172115  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0224  hypothetical protein  28.34 
 
 
247 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2582  hypothetical protein  28.34 
 
 
247 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1622  hypothetical protein  25.86 
 
 
287 aa  60.8  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0903  hypothetical protein  26.19 
 
 
237 aa  60.1  0.00000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.366145  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0059  hypothetical protein  27.65 
 
 
265 aa  51.2  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110579  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1000  hypothetical protein  28.47 
 
 
252 aa  46.2  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.130745  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02098  hypothetical protein  22.73 
 
 
367 aa  43.9  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>