20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1706 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1706  hypothetical protein  100 
 
 		 68 aa  135  2e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2257  hypothetical protein  64.62 
 
 		 117 aa  90.9  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000746631  normal  0.446754 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1129  hypothetical protein  63.08 
 
 		 67 aa  88.2  4e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1551  hypothetical protein  62.12 
 
 		 67 aa  87.8  4e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0253  addiction module component  40 
 
 		 74 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.372045  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0353  addiction module component  44.44 
 
 		 72 aa  63.5  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2726  addiction module component  46.03 
 
 		 88 aa  61.6  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0583  hypothetical protein  43.75 
 
 		 78 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000149229  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1323  hypothetical protein  43.75 
 
 		 78 aa  57.8  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000192785  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0133  addiction module component, TIGR02574 family  38.46 
 
 		 71 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1103  addiction module component  40 
 
 		 73 aa  54.3  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0591  addiction module component, TIGR02574 family  44.44 
 
 		 76 aa  53.9  0.0000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0280  addiction module component, TIGR02574 family  45.45 
 
 		 76 aa  52.8  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0331171  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4020  hypothetical protein  36.51 
 
 		 71 aa  51.6  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2635  addiction module component, TIGR02574 family  35.38 
 
 		 74 aa  48.5  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.476952  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0031  hypothetical protein  32.73 
 
 		 60 aa  45.8  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1114  addiction module component, TIGR02574 family  38.46 
 
 		 76 aa  43.9  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0713  hypothetical protein  39.68 
 
 		 77 aa  43.5  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.03321 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2340  addiction module component, TIGR02574 family  39.34 
 
 		 74 aa  42.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2140  addiction module component, TIGR02574 family  38.1 
 
 		 76 aa  40.4  0.009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.576441  normal  0.236191 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>