20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0133 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0133  addiction module component, TIGR02574 family  100 
 
 
71 aa  135  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1129  hypothetical protein  41.79 
 
 
67 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2257  hypothetical protein  38.81 
 
 
117 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000746631  normal  0.446754 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1551  hypothetical protein  40 
 
 
67 aa  55.5  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1706  hypothetical protein  38.46 
 
 
68 aa  54.7  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0583  hypothetical protein  41.18 
 
 
78 aa  54.7  0.0000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000149229  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1323  hypothetical protein  41.18 
 
 
78 aa  53.9  0.0000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000192785  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4020  hypothetical protein  39.39 
 
 
71 aa  53.1  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0713  hypothetical protein  41.54 
 
 
77 aa  52.4  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.03321 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1114  addiction module component, TIGR02574 family  41.94 
 
 
76 aa  52  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2726  addiction module component  35.71 
 
 
88 aa  51.2  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1826  hypothetical protein  48 
 
 
69 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00476342  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2635  addiction module component, TIGR02574 family  30.99 
 
 
74 aa  49.7  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.476952  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0031  hypothetical protein  48.78 
 
 
60 aa  48.9  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0280  addiction module component, TIGR02574 family  38.81 
 
 
76 aa  47.8  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0331171  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0353  addiction module component  37.7 
 
 
72 aa  47.8  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0253  addiction module component  29.58 
 
 
74 aa  46.2  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.372045  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0591  addiction module component, TIGR02574 family  35.38 
 
 
76 aa  45.1  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2340  addiction module component, TIGR02574 family  36.23 
 
 
74 aa  43.5  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1259  hypothetical protein  38.89 
 
 
70 aa  40  0.01  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000635316 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>