15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2140 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2140  addiction module component, TIGR02574 family  100 
 
 
76 aa  150  8e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.576441  normal  0.236191 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0713  hypothetical protein  42.65 
 
 
77 aa  58.2  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.03321 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0591  addiction module component, TIGR02574 family  43.66 
 
 
76 aa  57.4  0.00000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0280  addiction module component, TIGR02574 family  43.66 
 
 
76 aa  56.2  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0331171  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4757  hypothetical protein  37.14 
 
 
76 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0127929  hitchhiker  0.00000000461587 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0253  addiction module component  37.88 
 
 
74 aa  50.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.372045  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2340  addiction module component, TIGR02574 family  44.12 
 
 
74 aa  49.7  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1751  prevent-host-death protein  43.75 
 
 
145 aa  47  0.00009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0353  addiction module component  40 
 
 
72 aa  45.1  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1114  addiction module component, TIGR02574 family  33.87 
 
 
76 aa  43.9  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1551  hypothetical protein  38.71 
 
 
67 aa  43.5  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2257  hypothetical protein  38.1 
 
 
117 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000746631  normal  0.446754 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0583  hypothetical protein  37.33 
 
 
78 aa  41.6  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000149229  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1323  hypothetical protein  36 
 
 
78 aa  40.4  0.009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000192785  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1706  hypothetical protein  38.1 
 
 
68 aa  40.4  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>