20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0280 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0280  addiction module component, TIGR02574 family  100 
 
 		 76 aa  153  9e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0331171  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0591  addiction module component, TIGR02574 family  55.26 
 
 		 76 aa  85.1  3e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1751  prevent-host-death protein  44.12 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0713  hypothetical protein  39.47 
 
 		 77 aa  57  0.00000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.03321 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2140  addiction module component, TIGR02574 family  43.66 
 
 		 76 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.576441  normal  0.236191 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2275  hypothetical protein  43.42 
 
 		 76 aa  54.3  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.146462  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0253  addiction module component  40.91 
 
 		 74 aa  53.9  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.372045  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1114  addiction module component, TIGR02574 family  45.16 
 
 		 76 aa  53.9  0.0000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1706  hypothetical protein  45.45 
 
 		 68 aa  52.8  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1551  hypothetical protein  43.94 
 
 		 67 aa  52  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2257  hypothetical protein  38.81 
 
 		 117 aa  50.8  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000746631  normal  0.446754 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0353  addiction module component  45 
 
 		 72 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0133  addiction module component, TIGR02574 family  38.81 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2166  hypothetical protein  35.62 
 
 		 74 aa  46.2  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4757  hypothetical protein  36.92 
 
 		 76 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0127929  hitchhiker  0.00000000461587 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1129  hypothetical protein  34.85 
 
 		 67 aa  44.7  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2726  addiction module component  32.84 
 
 		 88 aa  43.9  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2635  addiction module component, TIGR02574 family  35.29 
 
 		 74 aa  43.5  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.476952  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0583  hypothetical protein  37.5 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000149229  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0031  hypothetical protein  42.11 
 
 		 60 aa  40  0.009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>