15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2635 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_2635  addiction module component, TIGR02574 family  100 
 
 
74 aa  152  2e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.476952  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0253  addiction module component  58.33 
 
 
74 aa  90.5  8e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.372045  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1114  addiction module component, TIGR02574 family  47.89 
 
 
76 aa  67  0.00000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1103  addiction module component  45.59 
 
 
73 aa  65.5  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0591  addiction module component, TIGR02574 family  42.19 
 
 
76 aa  53.9  0.0000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0713  hypothetical protein  37.31 
 
 
77 aa  53.5  0.0000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.03321 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0305  hypothetical protein  34.67 
 
 
76 aa  52  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.601973  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1129  hypothetical protein  35.82 
 
 
67 aa  50.4  0.000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4757  hypothetical protein  35.71 
 
 
76 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0127929  hitchhiker  0.00000000461587 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1551  hypothetical protein  32.31 
 
 
67 aa  49.3  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0133  addiction module component, TIGR02574 family  30.99 
 
 
71 aa  49.7  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0353  addiction module component  35.94 
 
 
72 aa  48.9  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1706  hypothetical protein  35.38 
 
 
68 aa  48.5  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2257  hypothetical protein  35.82 
 
 
117 aa  47.4  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000746631  normal  0.446754 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0280  addiction module component, TIGR02574 family  35.29 
 
 
76 aa  43.5  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0331171  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>