17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1129 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_1129  hypothetical protein  100 
 
 
67 aa  135  1e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1706  hypothetical protein  63.08 
 
 
68 aa  88.2  4e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2257  hypothetical protein  64.18 
 
 
117 aa  87.4  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000746631  normal  0.446754 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1551  hypothetical protein  53.85 
 
 
67 aa  75.1  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0133  addiction module component, TIGR02574 family  41.79 
 
 
71 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0353  addiction module component  36.51 
 
 
72 aa  56.2  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2726  addiction module component  40 
 
 
88 aa  56.2  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1103  addiction module component  36.92 
 
 
73 aa  54.3  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4020  hypothetical protein  39.06 
 
 
71 aa  53.9  0.0000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0583  hypothetical protein  40.62 
 
 
78 aa  53.1  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000149229  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1323  hypothetical protein  40.62 
 
 
78 aa  52.8  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000192785  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0253  addiction module component  32.31 
 
 
74 aa  52  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.372045  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1114  addiction module component, TIGR02574 family  40.3 
 
 
76 aa  51.6  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2635  addiction module component, TIGR02574 family  35.82 
 
 
74 aa  50.4  0.000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.476952  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0591  addiction module component, TIGR02574 family  39.06 
 
 
76 aa  48.5  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0280  addiction module component, TIGR02574 family  34.85 
 
 
76 aa  44.7  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0331171  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0031  hypothetical protein  30.91 
 
 
60 aa  42.4  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>