13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2340 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2340  addiction module component, TIGR02574 family  100 
 
 		 74 aa  144  3e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0583  hypothetical protein  49.32 
 
 		 78 aa  70.5  0.000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000149229  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1323  hypothetical protein  47.95 
 
 		 78 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000192785  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2726  addiction module component  45.45 
 
 		 88 aa  62  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0713  hypothetical protein  35.21 
 
 		 77 aa  51.2  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.03321 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2140  addiction module component, TIGR02574 family  44.12 
 
 		 76 aa  49.7  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.576441  normal  0.236191 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4020  hypothetical protein  38.03 
 
 		 71 aa  49.3  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1114  addiction module component, TIGR02574 family  37.33 
 
 		 76 aa  47.8  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0591  addiction module component, TIGR02574 family  35.71 
 
 		 76 aa  44.7  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0133  addiction module component, TIGR02574 family  36.23 
 
 		 71 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2257  hypothetical protein  39.34 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000746631  normal  0.446754 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1706  hypothetical protein  39.34 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0353  addiction module component  31.75 
 
 		 72 aa  40.4  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>