17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0583 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_0583  hypothetical protein  100 
 
 
78 aa  160  8.000000000000001e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000149229  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1323  hypothetical protein  97.44 
 
 
78 aa  156  7e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000192785  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2340  addiction module component, TIGR02574 family  49.32 
 
 
74 aa  70.5  0.000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2726  addiction module component  48.53 
 
 
88 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1706  hypothetical protein  43.75 
 
 
68 aa  58.5  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0133  addiction module component, TIGR02574 family  41.18 
 
 
71 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0353  addiction module component  39.13 
 
 
72 aa  54.3  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1129  hypothetical protein  40.62 
 
 
67 aa  53.1  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4020  hypothetical protein  40.91 
 
 
71 aa  52.8  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2257  hypothetical protein  39.06 
 
 
117 aa  52  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000746631  normal  0.446754 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0591  addiction module component, TIGR02574 family  40.58 
 
 
76 aa  50.8  0.000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0253  addiction module component  35.82 
 
 
74 aa  48.9  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.372045  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1551  hypothetical protein  42.86 
 
 
67 aa  48.9  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0713  hypothetical protein  36.49 
 
 
77 aa  48.5  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.03321 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1114  addiction module component, TIGR02574 family  31.34 
 
 
76 aa  43.5  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2140  addiction module component, TIGR02574 family  37.33 
 
 
76 aa  41.6  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.576441  normal  0.236191 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0280  addiction module component, TIGR02574 family  37.5 
 
 
76 aa  41.2  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0331171  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>