42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1572 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1572  protein of unknown function DUF125 transmembrane  100 
 
 		 291 aa  587  1e-167  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.493606  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0801  protein of unknown function DUF125 transmembrane  79.93 
 
 		 291 aa  482  1e-135  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1070  hypothetical protein  74.22 
 
 		 292 aa  461  1e-129  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1189  hypothetical protein  73.7 
 
 		 291 aa  457  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1272  hypothetical protein  73.36 
 
 		 291 aa  450  1e-125  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.679306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1196  protein of unknown function DUF125 transmembrane  65.74 
 
 		 285 aa  400  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.679365 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0912  protein of unknown function DUF125 transmembrane  63.32 
 
 		 291 aa  380  1e-104  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0438  hypothetical protein  52.28 
 
 		 284 aa  285  7e-76  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0423  hypothetical protein  52.28 
 
 		 284 aa  285  7e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1514  hypothetical protein  50.73 
 
 		 292 aa  281  8.000000000000001e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000671391  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0215  protein of unknown function DUF125 transmembrane  50.18 
 
 		 300 aa  281  1e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0860  hypothetical protein  51.44 
 
 		 293 aa  279  3e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.110107  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1809  hypothetical protein  47.27 
 
 		 288 aa  270  2e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.305818  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1173  protein of unknown function DUF125 transmembrane  49.28 
 
 		 293 aa  268  8e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1685  protein of unknown function DUF125 transmembrane  51.82 
 
 		 289 aa  268  8.999999999999999e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1653  hypothetical protein  51.09 
 
 		 291 aa  266  2.9999999999999995e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.850435  normal  0.0303841 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01890  uncharacterized membrane protein  48.11 
 
 		 297 aa  251  1e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1049  hypothetical protein  48.13 
 
 		 293 aa  229  3e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0331  hypothetical protein  40.7 
 
 		 287 aa  217  2e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.464299  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2800  protein of unknown function DUF125 transmembrane  44.18 
 
 		 292 aa  217  2e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.792813  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0496  hypothetical protein  37.02 
 
 		 299 aa  165  9e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1758  hypothetical protein  35.89 
 
 		 297 aa  158  1e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0216697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0704  hypothetical protein  35.76 
 
 		 299 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.258152  normal  0.502019 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0774  hypothetical protein  35.54 
 
 		 297 aa  154  2e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.443952 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1650  hypothetical protein  31.83 
 
 		 290 aa  123  3e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.381623  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0835  protein of unknown function DUF125 transmembrane  27.22 
 
 		 358 aa  99.8  5e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1094  hypothetical protein  30.61 
 
 		 374 aa  88.2  1e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0378  protein of unknown function DUF125 transmembrane  28.43 
 
 		 352 aa  83.6  0.000000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0516728  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1468  protein of unknown function DUF125 transmembrane  28.65 
 
 		 361 aa  71.6  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000181021  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0522  hypothetical protein  26.77 
 
 		 319 aa  66.2  0.0000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.655797  normal  0.060241 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4424  hypothetical protein  27.03 
 
 		 368 aa  65.1  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0379  hypothetical protein  35.04 
 
 		 362 aa  61.2  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04290  uncharacterized membrane protein  26.34 
 
 		 376 aa  61.2  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0254  protein of unknown function DUF125 transmembrane  27.36 
 
 		 360 aa  60.8  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0844  hypothetical protein  25.26 
 
 		 387 aa  54.7  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01320  uncharacterized membrane protein  26.02 
 
 		 365 aa  53.9  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0962  protein of unknown function DUF125 transmembrane  23.96 
 
 		 396 aa  50.1  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1689  hypothetical protein  26.49 
 
 		 383 aa  49.7  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3216  protein of unknown function DUF125 transmembrane  27.18 
 
 		 389 aa  47.4  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000032928 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0254  protein of unknown function DUF125 transmembrane  26.56 
 
 		 401 aa  46.6  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.171497  normal  0.932385 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0161  protein of unknown function DUF125 transmembrane  26.49 
 
 		 399 aa  46.6  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.279325  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19590  uncharacterized membrane protein  33.8 
 
 		 232 aa  42.4  0.009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.927854  normal  0.04221 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>