78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1421 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1421  hypothetical protein  100 
 
 		 265 aa  544  1e-154  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0531  protein of unknown function DUF455  84.91 
 
 		 265 aa  456  1e-127  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2706  hypothetical protein  55.21 
 
 		 336 aa  296  3e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2139  hypothetical protein  56.11 
 
 		 283 aa  296  3e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1899  hypothetical protein  55.21 
 
 		 319 aa  296  3e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3130  hypothetical protein  55.21 
 
 		 336 aa  296  3e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.163589  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2626  hypothetical protein  55.21 
 
 		 272 aa  296  3e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1685  hypothetical protein  55.21 
 
 		 283 aa  295  5e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0445395  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2188  hypothetical protein  55.21 
 
 		 272 aa  294  9e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1461  hypothetical protein  55.21 
 
 		 272 aa  294  9e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2572  hypothetical protein  55.21 
 
 		 276 aa  294  1e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0898  hypothetical protein  51.53 
 
 		 280 aa  292  3e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.549388  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1042  hypothetical protein  51.53 
 
 		 280 aa  292  3e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.839264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2102  hypothetical protein  55.51 
 
 		 286 aa  292  4e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5975  hypothetical protein  55.51 
 
 		 286 aa  292  4e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2120  hypothetical protein  55.51 
 
 		 286 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00584011 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2012  hypothetical protein  57.09 
 
 		 283 aa  290  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00178235 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0977  protein of unknown function DUF455  53.41 
 
 		 294 aa  288  5.0000000000000004e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.534107  normal  0.0470434 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1172  hypothetical protein  55.38 
 
 		 285 aa  288  6e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000837693 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1096  hypothetical protein  53.23 
 
 		 301 aa  288  7e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1073  protein of unknown function DUF455  53.18 
 
 		 294 aa  287  1e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.146686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1060  hypothetical protein  52.06 
 
 		 283 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1434  hypothetical protein  54.79 
 
 		 284 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5408  hypothetical protein  55.87 
 
 		 285 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2555  protein of unknown function DUF455  61.5 
 
 		 309 aa  277  1e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00755068  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3453  protein of unknown function DUF455  51.89 
 
 		 270 aa  276  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3189  hypothetical protein  53.18 
 
 		 273 aa  275  7e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1578  hypothetical protein  62.93 
 
 		 246 aa  273  3e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.423953  normal  0.769891 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1134  hypothetical protein  52.04 
 
 		 268 aa  271  7e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1443  hypothetical protein  48.89 
 
 		 259 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0403577  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1177  hypothetical protein  51.88 
 
 		 300 aa  265  8e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.298234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0583  hypothetical protein  52.82 
 
 		 276 aa  264  1e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.874814  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1317  hypothetical protein  50.76 
 
 		 276 aa  262  3e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5113  hypothetical protein  50.38 
 
 		 268 aa  261  1e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.565314 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0992  hypothetical protein  48.5 
 
 		 268 aa  258  9e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0907  protein of unknown function DUF455  48.12 
 
 		 268 aa  257  1e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.548684  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0883  hypothetical protein  52.61 
 
 		 255 aa  251  9.000000000000001e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2112  hypothetical protein  46.15 
 
 		 280 aa  247  2e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.101925  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1165  hypothetical protein  46.69 
 
 		 277 aa  238  5.999999999999999e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1119  hypothetical protein  50.58 
 
 		 264 aa  238  5.999999999999999e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0467888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1152  hypothetical protein  46.74 
 
 		 290 aa  232  5e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0932  protein of unknown function DUF455  46.48 
 
 		 276 aa  229  2e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0728001  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0813  protein of unknown function DUF455  43.35 
 
 		 274 aa  225  6e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.959297 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2484  hypothetical protein  50.24 
 
 		 278 aa  225  7e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.881493  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02503  hypothetical protein  41.09 
 
 		 278 aa  219  3.9999999999999997e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.87176  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1406  protein of unknown function DUF455  50.25 
 
 		 219 aa  214  9.999999999999999e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1923  protein of unknown function DUF455  43.68 
 
 		 278 aa  210  2e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2019  hypothetical protein  60.38 
 
 		 161 aa  205  7e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.739901  normal  0.947675 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3271  hypothetical protein  41.18 
 
 		 271 aa  202  5e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1177  protein of unknown function DUF455  46.41 
 
 		 285 aa  201  9.999999999999999e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0199294  normal  0.399239 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1053  hypothetical protein  45.87 
 
 		 274 aa  195  5.000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.108058  normal  0.790191 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2183  hypothetical protein  41.04 
 
 		 263 aa  194  1e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1883  hypothetical protein  45.15 
 
 		 260 aa  193  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2263  hypothetical protein  42.99 
 
 		 275 aa  194  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1090  hypothetical protein  44.98 
 
 		 280 aa  193  3e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.54016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1476  hypothetical protein  39.84 
 
 		 275 aa  192  6e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.444109  normal  0.0249969 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2118  protein of unknown function DUF455  39.77 
 
 		 275 aa  192  6e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12037  decreased coverage  0.00309325 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1911  protein of unknown function DUF455  39.38 
 
 		 275 aa  191  9e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.489246 
 
 
-
 
NC_004310  BR0923  hypothetical protein  42.34 
 
 		 275 aa  190  2e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.935727  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1305  hypothetical protein  41.15 
 
 		 271 aa  177  2e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.823956  normal  0.719923 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2528  hypothetical protein  35.23 
 
 		 275 aa  175  6e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.185965  normal  0.122496 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3914  hypothetical protein  38.57 
 
 		 281 aa  169  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3156  hypothetical protein  38.13 
 
 		 264 aa  167  2e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0607  hypothetical protein  35.61 
 
 		 265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1256  hypothetical protein  35.61 
 
 		 265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1131  hypothetical protein  35.23 
 
 		 265 aa  163  3e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07364  beta-1,4-xylosidase (Eurofung)  33.33 
 
 		 446 aa  158  1e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0916  hypothetical protein  34.51 
 
 		 270 aa  153  2.9999999999999998e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0882  hypothetical protein  33.6 
 
 		 267 aa  152  5.9999999999999996e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1089  hypothetical protein  34.87 
 
 		 271 aa  149  3e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1262  hypothetical protein  39.57 
 
 		 270 aa  146  3e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_4617  predicted protein  38.64 
 
 		 319 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.116659  normal  0.884452 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03830  conserved hypothetical protein  33.19 
 
 		 546 aa  132  6.999999999999999e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40450  predicted protein  37.5 
 
 		 268 aa  126  3e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.765756  normal  0.016876 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0122  hypothetical protein  58.21 
 
 		 117 aa  79  0.00000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.836482  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0122  hypothetical protein  58.21 
 
 		 117 aa  79  0.00000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1412  protein of unknown function DUF455  26.85 
 
 		 266 aa  73.6  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0410117  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2016  hypothetical protein  65.91 
 
 		 103 aa  57.8  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.375454  normal  0.892159 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>