65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0430 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0430  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 305 aa  628  1e-179  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0436  polysaccharide deacetylase  92.13 
 
 		 305 aa  585  1e-166  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.838323 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1410  polysaccharide deacetylase  65.13 
 
 		 298 aa  410  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.257761 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1801  polysaccharide deacetylase  65.68 
 
 		 298 aa  411  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1773  polysaccharide deacetylase  65.68 
 
 		 298 aa  411  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.771861 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5164  polysaccharide deacetylase  64.69 
 
 		 298 aa  410  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.372387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1863  polysaccharide deacetylase  65.35 
 
 		 298 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6216  polysaccharide deacetylase  65.35 
 
 		 298 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1887  polysaccharide deacetylase  65.35 
 
 		 298 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.65071  hitchhiker  0.000000465895 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1797  polysaccharide deacetylase  63.7 
 
 		 297 aa  401  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00908915 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2405  polysaccharide deacetylase family protein  63.28 
 
 		 298 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.498763  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2279  polysaccharide deacetylase family protein  63.28 
 
 		 298 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1156  polysaccharide deacetylase family protein  63.28 
 
 		 298 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.540807  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2189  polysaccharide deacetylase family protein  63.93 
 
 		 298 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0210397  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2390  putative polysaccharide deacetylase  63.7 
 
 		 297 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192005  normal  0.179282 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2241  polysaccharide deacetylase family protein  63.28 
 
 		 298 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1394  polysaccharide deacetylase family protein  63.28 
 
 		 298 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1884  polysaccharide deacetylase family protein  63.28 
 
 		 298 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.243781  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0013  polysaccharide deacetylase family protein  63.28 
 
 		 298 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.478406  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0922  polysaccharide deacetylase  64.03 
 
 		 298 aa  396  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.603398 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1318  hypothetical protein  63.7 
 
 		 297 aa  387  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1193  polysaccharide deacetylase  61.39 
 
 		 297 aa  374  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0326614  normal  0.124645 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1254  polysaccharide deacetylase  60.73 
 
 		 297 aa  375  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.326584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3973  polysaccharide deacetylase  60.07 
 
 		 297 aa  377  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0986666  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4593  polysaccharide deacetylase  60.07 
 
 		 296 aa  362  4e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000328095  hitchhiker  0.00511566 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2979  polysaccharide deacetylase  39.18 
 
 		 302 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1416  polysaccharide deacetylase  41.39 
 
 		 301 aa  214  1.9999999999999998e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0277  polysaccharide deacetylase  38.82 
 
 		 298 aa  207  2e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0882  polysaccharide deacetylase  38.49 
 
 		 308 aa  199  7e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.698941  hitchhiker  0.000000806635 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3232  polysaccharide deacetylase  37.54 
 
 		 301 aa  193  4e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3699  polysaccharide deacetylase  35.88 
 
 		 297 aa  186  5e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0923  polysaccharide deacetylase  35.79 
 
 		 305 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.213028 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1353  polysaccharide deacetylase  36.89 
 
 		 297 aa  179  4e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2557  polysaccharide deacetylase family protein  36.21 
 
 		 311 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2925  polysaccharide deacetylase  36.51 
 
 		 297 aa  179  5.999999999999999e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2157  polysaccharide deacetylase  36.36 
 
 		 301 aa  176  4e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2609  hypothetical protein  35.48 
 
 		 301 aa  174  9.999999999999999e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1834  polysaccharide deacetylase  35.48 
 
 		 301 aa  174  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1728  polysaccharide deacetylase  35.48 
 
 		 301 aa  174  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2436  polysaccharide deacetylase  36.62 
 
 		 299 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2644  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  36.31 
 
 		 299 aa  165  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2485  polysaccharide deacetylase domain protein  36.31 
 
 		 299 aa  165  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4018  polysaccharide deacetylase  35.29 
 
 		 299 aa  165  8e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.745144  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2540  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  36.31 
 
 		 299 aa  165  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.742561  normal  0.731113 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2528  polysaccharide deacetylase domain protein  35.99 
 
 		 299 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2692  polysaccharide deacetylase  35.39 
 
 		 293 aa  163  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.145511  normal  0.370687 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1590  hypothetical protein  38.15 
 
 		 295 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18340  hypothetical protein  38.15 
 
 		 295 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2410  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  36.9 
 
 		 296 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2551  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  36.53 
 
 		 296 aa  162  9e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1393  polysaccharide deacetylase  36.53 
 
 		 296 aa  161  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02182  hypothetical protein  36.53 
 
 		 296 aa  161  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2401  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  36.53 
 
 		 296 aa  161  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2844  polysaccharide deacetylase  34.65 
 
 		 294 aa  161  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0804894  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02141  hypothetical protein  36.53 
 
 		 296 aa  161  1e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1402  polysaccharide deacetylase  36.53 
 
 		 296 aa  161  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3397  polysaccharide deacetylase domain protein  36.53 
 
 		 296 aa  161  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4227  polysaccharide deacetylase  35.79 
 
 		 299 aa  160  3e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2632  polysaccharide deacetylase domain protein  36.16 
 
 		 296 aa  159  4e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2076  polysaccharide deacetylase  34.53 
 
 		 298 aa  157  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0999  polysaccharide deacetylase  27.86 
 
 		 294 aa  45.8  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.289502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3937  polysaccharide deacetylase  25.58 
 
 		 293 aa  45.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.629256  normal  0.0112723 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5882  polysaccharide deacetylase family protein  27.14 
 
 		 293 aa  44.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3296  polysaccharide deacetylase  25.62 
 
 		 315 aa  43.9  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4203  polysaccharide deacetylase family protein  25 
 
 		 293 aa  43.9  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.509366  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>