More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4933 on replicon NC_008759
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008759  Pnap_4933  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  100 
 
 
355 aa  723    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.295816  normal  0.267095 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1931  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.46 
 
 
287 aa  89.4  9e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.741466  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07115  SpoOJ regulator protein  27.14 
 
 
254 aa  89  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15300  chromosome partitioning ATPase  26.92 
 
 
290 aa  87.4  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.087048  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19910  chromosome partitioning ATPase  28.08 
 
 
293 aa  87.8  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.570833  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2097  chromosome segregation ATPase  25.27 
 
 
265 aa  87.4  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11723  initiation inhibitor protein  27.31 
 
 
318 aa  86.7  6e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.37238 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3117  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.86 
 
 
294 aa  86.7  7e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2335  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.38 
 
 
259 aa  86.3  7e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000329559  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3279  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.94 
 
 
298 aa  86.3  8e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3948  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.2 
 
 
316 aa  85.9  9e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.056511 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2453  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.82 
 
 
339 aa  85.5  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0641212  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0972  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.21 
 
 
317 aa  85.5  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1888  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.27 
 
 
265 aa  84.7  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0202  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.11 
 
 
255 aa  85.1  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5608  ParA family protein  27.44 
 
 
263 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3898  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.17 
 
 
316 aa  83.6  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.475891  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5130  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.44 
 
 
263 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2932  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.17 
 
 
279 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2993  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.96 
 
 
302 aa  83.2  0.000000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.504327  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5065  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.1 
 
 
329 aa  83.2  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.995886  normal  0.0360395 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3425  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.47 
 
 
253 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2947  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.17 
 
 
290 aa  83.2  0.000000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.297799  normal  0.346271 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2976  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.17 
 
 
290 aa  83.2  0.000000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1267  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.31 
 
 
293 aa  82.8  0.000000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1450  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.63 
 
 
329 aa  82.8  0.000000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00757148 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3321  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.87 
 
 
253 aa  82.8  0.000000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1742  chromosome partitioning ATPase  26.24 
 
 
257 aa  82.8  0.000000000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000936624  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1561  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.93 
 
 
303 aa  82  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.372199  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4057  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.88 
 
 
352 aa  82  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.773684 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1202  putative partitioning or sporulation protein  27.65 
 
 
319 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2993  chromosome partitioning ATPase  26.52 
 
 
315 aa  82  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2493  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.2 
 
 
367 aa  82.4  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.945625  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1566  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.47 
 
 
256 aa  82.4  0.00000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3498  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.2 
 
 
303 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.975248  normal  0.228635 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1410  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.18 
 
 
261 aa  81.3  0.00000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3835  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.69 
 
 
316 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.10007  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2439  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.11 
 
 
265 aa  81.6  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3976  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.95 
 
 
316 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0294413  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5177  sporulation initiation inhibitor  26.52 
 
 
253 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3553  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.11 
 
 
253 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1240  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.63 
 
 
297 aa  80.9  0.00000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.345121  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5631  sporulation initiation inhibitor protein Soj  26.2 
 
 
253 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5333  sporulation initiation inhibitor protein Soj  26.2 
 
 
253 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5161  sporulation initiation inhibitor  26.2 
 
 
253 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5730  sporulation initiation inhibitor protein Soj  26.2 
 
 
253 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1490  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.76 
 
 
298 aa  80.5  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.630454  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5590  sporulation initiation inhibitor protein Soj  26.2 
 
 
253 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000114742 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5607  sporulation initiation inhibitor protein Soj  26.2 
 
 
253 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.907427  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5667  sporulation initiation inhibitor protein Soj  26.2 
 
 
253 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5328  sporulation initiation inhibitor protein Soj  26.2 
 
 
253 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000106044 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5209  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.44 
 
 
263 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25370  chromosome partitioning ATPase  27.1 
 
 
332 aa  80.5  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.401213 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3413  chromosome segregation ATPase  25.67 
 
 
257 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2056  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.54 
 
 
265 aa  80.5  0.00000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5429  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.72 
 
 
322 aa  80.1  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.11094  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14150  chromosome segregation ATPase  27.34 
 
 
294 aa  80.1  0.00000000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  26.22 
 
 
256 aa  80.1  0.00000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1531  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.77 
 
 
299 aa  79.7  0.00000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000837624 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.44 
 
 
263 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25 
 
 
273 aa  80.1  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.488481 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14080  chromosome partitioning ATPase  26.92 
 
 
327 aa  80.1  0.00000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011735  BbuZS7_X32  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain protein  29.07 
 
 
260 aa  79.7  0.00000000000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.0000524469  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3138  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.31 
 
 
362 aa  79.7  0.00000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0284667  normal  0.214127 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0002  ParA family protein  27.44 
 
 
263 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442351  hitchhiker  0.000159031 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.44 
 
 
263 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.301743  normal  0.0393048 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1531  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.97 
 
 
303 aa  79.3  0.00000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.265392  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0834  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.47 
 
 
336 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5273  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.83 
 
 
253 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13953  chromosome partitioning protein parA  26.59 
 
 
347 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23520  chromosome segregation ATPase  24.71 
 
 
249 aa  79  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.502901  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7333  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.28 
 
 
470 aa  79.3  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.946911  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1803  ParaA family ATPase  22.86 
 
 
265 aa  78.6  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.833868  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002837  SOJ-like and chromosome partitioning protein  26.8 
 
 
259 aa  78.6  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2087  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.42 
 
 
265 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0241  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.75 
 
 
300 aa  78.2  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.811562  normal  0.0256625 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5739  chromosome segregation ATPase  26.32 
 
 
265 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268007  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0479  putative sporulation initiation inhibitor protein Soj  28.29 
 
 
279 aa  77.8  0.0000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5239  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.37 
 
 
259 aa  77.8  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000091984  hitchhiker  0.0000000000884158 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03139  hypothetical protein  26.4 
 
 
259 aa  77.4  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0031  chromosome segregation ATPase  26.59 
 
 
259 aa  77  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4020  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.38 
 
 
253 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3326  putative chromosome partitioning protein PARA  26.2 
 
 
261 aa  76.6  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00529695  normal  0.207429 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0017  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.14 
 
 
262 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000361786  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2878  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.88 
 
 
277 aa  76.6  0.0000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.504433  normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4104  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.34 
 
 
397 aa  76.6  0.0000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.324179  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3884  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.33 
 
 
264 aa  76.6  0.0000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0503158  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2156  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.54 
 
 
337 aa  76.3  0.0000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371685  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28490  chromosome segregation ATPase  30.77 
 
 
348 aa  76.3  0.0000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.150947  hitchhiker  0.00113188 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2820  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.29 
 
 
312 aa  76.3  0.0000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.217261  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2806  chromosome segregation ATPase  26.28 
 
 
261 aa  75.9  0.0000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0253232  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0142  SpoOJ regulator protein  29.57 
 
 
258 aa  75.9  0.000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0452  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.01 
 
 
295 aa  75.5  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.402264  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0095  ParA family chromosome partitioning ATPase  30.64 
 
 
261 aa  75.5  0.000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0206  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.09 
 
 
262 aa  75.9  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0134114  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.49 
 
 
253 aa  75.5  0.000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.491233  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4616  chromosome segregation ATPase  25.76 
 
 
262 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4955  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.66 
 
 
383 aa  75.5  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1925  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.09 
 
 
307 aa  75.5  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.22168 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0135  ParA family chromosome partitioning ATPase  30.64 
 
 
261 aa  75.5  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>